材料与仪器
细胞
蔗糖溶液 高盐蔗糖铺垫液 蔗糖铺垫缓冲液 重悬缓冲液
蔗糖溶液 高盐蔗糖铺垫液 蔗糖铺垫缓冲液 重悬缓冲液
步骤
1. 为从剩余的细胞组分中分离核糖体,将不含细胞碎片的粗制裂解液以 1:1 的比例铺到 1.1 mol/L 的蔗糖溶液之上。于 4℃ 在Beckinan 50.2 Ti 恒定角度转头中离心,这一过程包括长时间的离心以使 70S 核糖体沉降,同时分离 30S 和 50S 核糖体亚基;较低的离心速度用于初步将 70S 核糖体沉淀出来,而 50S 或 30S 亚基则不沉淀。
(1) 真细菌核糖体
高盐蔗糖铺垫液:
20 mmol/L Tris-HCl,pH 7.5
50 mmol/L MgOAc
100 mmol/L NH4Cl
1 mmol/L DTT
0.5 mmol/L EDTA
1.1 mmol/L 蔗糖
以 100000 g 离心 16 小时来沉降 70S 核糖体,可以更换蔗糖铺垫液 2 至 3 次直到获得干净的沉淀物。对于产甲烷菌(mefftancgem),盐杆菌及硫代谢嗜热菌(eocytes, sulfur-metabolizing ),至少应用高盐溶液洗两次以确保将非核糖体沉淀去除掉。
(2) 哺乳动物核糖体
蔗糖铺垫缓冲液:
50 mmol/L Tris-HCl,pH 7.5
5 mmol/L MgCl2
25 mmol/L KCl
2 mmol/L 蔗糖
以 100000 g 离心 24 小时,沉淀中含有多核糖体,可贮存于 -80℃ 中。
(3) 植物核糖体和多核糖体
蔗糖铺垫缓冲液:
20 mmol/L Tris-HCl,pH 7.6
5 mmol/L MgCl2
50 mmol/L ~ 200 mmol/L NH4CI
60% 蔗糖
以 150000 g 离心 3 小时。用重悬缓冲液洗沉淀物,然后悬于 200 μl 重悬缓冲液中。
重悬缓冲液:
50 mmol/L KCl
20 mmol/L Tris-HCl,pH 7.6
5 mmol/L MgCl2
对多核糖体的进一步纯化可转至多核糖体的纯化步骤。
(4) 叶绿体核糖体
高盐蔗糖铺垫缓冲液
10 mmol/L Tris-HCl,pH 7.5
10 mmol/L MgOAc
150 mmol/L KCl
6 mmol/L β-巯基乙醇
1 mol/L 蔗糖
以 55000 g 离心 12 小时。为除去蔗糖,用不含蔗糖的上述缓冲液漂洗并将沉淀重悬,然后于 4℃ 以 10000 g 离心 10 分钟使悬液澄清。将含有核糖体的沉淀贮存于 -80℃ 或继续进行下面的分离步骤。
2. 到这一阶段,含有核糖体的沉淀已经可以直接使用贮存于 -80℃ 或进一步纯化。
(1) 真细菌核糖体
高盐蔗糖铺垫液:
20 mmol/L Tris-HCl,pH 7.5
50 mmol/L MgOAc
100 mmol/L NH4Cl
1 mmol/L DTT
0.5 mmol/L EDTA
1.1 mmol/L 蔗糖
以 100000 g 离心 16 小时来沉降 70S 核糖体,可以更换蔗糖铺垫液 2 至 3 次直到获得干净的沉淀物。对于产甲烷菌(mefftancgem),盐杆菌及硫代谢嗜热菌(eocytes, sulfur-metabolizing ),至少应用高盐溶液洗两次以确保将非核糖体沉淀去除掉。
(2) 哺乳动物核糖体
蔗糖铺垫缓冲液:
50 mmol/L Tris-HCl,pH 7.5
5 mmol/L MgCl2
25 mmol/L KCl
2 mmol/L 蔗糖
以 100000 g 离心 24 小时,沉淀中含有多核糖体,可贮存于 -80℃ 中。
(3) 植物核糖体和多核糖体
蔗糖铺垫缓冲液:
20 mmol/L Tris-HCl,pH 7.6
5 mmol/L MgCl2
50 mmol/L ~ 200 mmol/L NH4CI
60% 蔗糖
以 150000 g 离心 3 小时。用重悬缓冲液洗沉淀物,然后悬于 200 μl 重悬缓冲液中。
重悬缓冲液:
50 mmol/L KCl
20 mmol/L Tris-HCl,pH 7.6
5 mmol/L MgCl2
对多核糖体的进一步纯化可转至多核糖体的纯化步骤。
(4) 叶绿体核糖体
高盐蔗糖铺垫缓冲液
10 mmol/L Tris-HCl,pH 7.5
10 mmol/L MgOAc
150 mmol/L KCl
6 mmol/L β-巯基乙醇
1 mol/L 蔗糖
以 55000 g 离心 12 小时。为除去蔗糖,用不含蔗糖的上述缓冲液漂洗并将沉淀重悬,然后于 4℃ 以 10000 g 离心 10 分钟使悬液澄清。将含有核糖体的沉淀贮存于 -80℃ 或继续进行下面的分离步骤。
2. 到这一阶段,含有核糖体的沉淀已经可以直接使用贮存于 -80℃ 或进一步纯化。
来源:丁香实验