材料与仪器
DNA
DNA测序缓冲液 dATP DNA聚合酶
热心换反应装置 离心机
DNA测序缓冲液 dATP DNA聚合酶
热心换反应装置 离心机
步骤
1. 对应于毎个待测模板,分别以A、G、C、T 标记好4个微量离心管。
2. 分别往标好A、G、C、T 的管子中,加A、G、C、T 测序混合液各3 μl。
2. 分别往标好A、G、C、T 的管子中,加A、G、C、T 测序混合液各3 μl。
3. 对于单链模板:在0.5 ml 微量离心管中混匀下列试剂
(1)0.04 pmol 单链DNA模板
(2)0.6 pmol 引物
(3)1.5 μl 10×VentR(exo-)测序缓冲液
(4)1 μl 3%Triton X-100
(5)加水至12 μl
(6)用吸管上下抽吸轻轻混匀溶液。
4. 对于双链DNA模板: 在0.5 ml 微量离心管中混匀下列试剂
(1)0.1 pmol 双链DNA模板
(2)1.2 pmol 引物
(3)1.5 μl 10×VentR(exo-)测序缓冲液
(4)1 μl 3%Triton X-100
(5)加水至12 μl
(6)通过用吸管上下抽吸,使溶液混匀。
5. 毎个模板/引物混合物加1~2 μl 10 mCi/ml[α-35S]dNATP、[α-32P]dNATP或[α-32P]dNATP,用吸管轻轻上下抽吸混合溶液。
6. 经步骤5操作后的管子,加入1 μl 2 000 U/ml 的VentR(exo-)DNA聚合酶。
(1)0.04 pmol 单链DNA模板
(2)0.6 pmol 引物
(3)1.5 μl 10×VentR(exo-)测序缓冲液
(4)1 μl 3%Triton X-100
(5)加水至12 μl
(6)用吸管上下抽吸轻轻混匀溶液。
4. 对于双链DNA模板: 在0.5 ml 微量离心管中混匀下列试剂
(1)0.1 pmol 双链DNA模板
(2)1.2 pmol 引物
(3)1.5 μl 10×VentR(exo-)测序缓冲液
(4)1 μl 3%Triton X-100
(5)加水至12 μl
(6)通过用吸管上下抽吸,使溶液混匀。
5. 毎个模板/引物混合物加1~2 μl 10 mCi/ml[α-35S]dNATP、[α-32P]dNATP或[α-32P]dNATP,用吸管轻轻上下抽吸混合溶液。
6. 经步骤5操作后的管子,加入1 μl 2 000 U/ml 的VentR(exo-)DNA聚合酶。
7. 立即往步骤2的含VentR(exo-)测序混合物A的管子中加入3.2 μl 步骤5操作后所得的混合物。
8. 分别重复此过程于C、G、T管,每次均换吸头,反应混合物,置于冰上。
9. 往每个反应混合物上滴入1滴无菌矿物油。
10. 在热循环反应装置中设定如下反应条件:20循环:20 s,90℃;20 s,55℃;20 s,72℃反应管放入热循环仪中,启动程序。
11. 在矿物油层下加入4 μl TCS终止/加样染料。
8. 分别重复此过程于C、G、T管,每次均换吸头,反应混合物,置于冰上。
9. 往每个反应混合物上滴入1滴无菌矿物油。
10. 在热循环反应装置中设定如下反应条件:20循环:20 s,90℃;20 s,55℃;20 s,72℃反应管放入热循环仪中,启动程序。
11. 在矿物油层下加入4 μl TCS终止/加样染料。
12. 样品在85℃温育3 min。
13. 将吸管头插入覆盖矿物油层下面的反应物中,取2 μl 加样于测序胶进行电泳,并读出序列。
13. 将吸管头插入覆盖矿物油层下面的反应物中,取2 μl 加样于测序胶进行电泳,并读出序列。
来源:丁香实验