材料与仪器
DNA
寡核苷酸引物 测序酶终止混合液 测序酶缓冲液 焦磷酸酶混合液
离心机 离心管 微量滴定板
寡核苷酸引物 测序酶终止混合液 测序酶缓冲液 焦磷酸酶混合液
离心机 离心管 微量滴定板
步骤
1. 对于每个单链模板:将下列试剂混合于0.5 ml 微量离心管中
(1)0.5 pmol 单链DNA模板
(2)0.5 pmol 引物
(3)1 μl 10×测序酶缓冲液
(4)加水至10 μl
(1)0.5 pmol 单链DNA模板
(2)0.5 pmol 引物
(3)1 μl 10×测序酶缓冲液
(4)加水至10 μl
(5)用吸管上下抽吸轻轻混匀(避免产生气泡)。于65℃温育6 min,然后于37 ℃温育20 min,转到步骤3。
2. 对于每个双链DNA模板:以下列混合液重溶含0.5 pmol 变性双链模板的干燥沉淀物。
(1)1 pmol 引物
(2)1 μl 10×测序酶缓冲液
(3)加水至10 μl
(4)用吸管上下抽吸轻轻混匀(避免产生气泡),于37℃温育30 min,然后在此退火温度下放置直至进行步骤3。
3. 当引物正和模板退火时,对应每个待测模板,分别标记好A、C、G、T 4个微量离心管。
DNA测序用酶的特性
3. 分别加入2.5 μl A、C、G、T 测序酶终止混合液至A、C、G、T管的底部
4. 在临用前,才用测序酶稀释液稀释测序酶/焦磷酸酶混合物至1~ 2 U 测序酶/μl,置于冰浴。
5. 将下列试剂加入已退火的引物和模板中
(1)2 μl 标记混合物
(2)0.5~1.5 μl 10 mCi/ml[α-32P]dATP
(3)2 μl 稀释的测序酶/焦磷酸酶混合液
(4)总体积在14.5~16 μl,于25℃(室温)温育5 min。
(1)2 μl 标记混合物
(2)0.5~1.5 μl 10 mCi/ml[α-32P]dATP
(3)2 μl 稀释的测序酶/焦磷酸酶混合液
(4)总体积在14.5~16 μl,于25℃(室温)温育5 min。
6. 加入3.5 μl 标记反应物至含测序酶终止混合物A的微量离心管中。
7. 用吸管上下抽吸轻轻混匀,对 A、C、G、T 管重复此过程,每次均需更换吸头,于37℃温育5~10 min。
7. 用吸管上下抽吸轻轻混匀,对 A、C、G、T 管重复此过程,每次均需更换吸头,于37℃温育5~10 min。
8. 加入4 μl 终止/加样染料液,于95℃水浴2 min,然后置于冰浴。
9. 每样品各取2~3 μl 加样于测序胶进行凝胶电泳并读出序列。
9. 每样品各取2~3 μl 加样于测序胶进行凝胶电泳并读出序列。
来源:丁香实验