染色质免疫共沉淀测序（chip-seq）

实验分类：

遗传学实验

最新修订时间：2023-05-05

合作专家 | 陈慕华博士

肿瘤学北京大学

审核专家 | 陈燚博士

肿瘤药理中国科学院上海药物研究所

简介

染色质免疫沉淀技术（Chromatin immunoprecipitation assay, ChIP）是目前唯一研究体内 DNA 与蛋白质相互作用的方法，主要包括 ChIP-qPCR 和 ChIP-seq 两种。利用 ChIP-seq 技术能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白修饰、转录因子等互作的 DNA 区段。

原理

真核生物的基因组 DNA 以染色质的形式存在。使用甲醛将目的蛋白和 DNA 交联固定，并通过超声处理或核酸酶消化使染色质碎裂；再利用抗体特异性沉淀分离组蛋白或转录因子等及其结合的染色质，即染色质免疫共沉淀产物；通过蛋白酶解交联，使目的蛋白与 DNA 分开，纯化 DNA 后通过下一代测序 (NGS) 技术检测和定量富集的 DNA 片段。