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简介
任意引物 PCR,英文名是 arbitrarily primed PCR,AP-PCR,也称随机扩增多态性 DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD),随机引物 PCR(random primer PCR,RP-PCR)。
目前,用于任意引物 PCR 的方法主要有 2 种:AP-PCR 方法和 RAP-PCR 方法。
原理
任意引物 PCR 的基本原理:
不同物种的基因组中与引物相匹配的碱基序列的空间位置和数目都有可能不同,因而扩增产物的大小和数量也可能不同。
任意引物 PCR 的技术特点主要有以下几个方面:
本技术由于所选用的引物碱基排列是随机的,故可以在对物种 DNA 序列信息完全缺乏了解的情况下,对物种的基因组进行 DNA 片段多态性分析,最后可通过统计分析确定其在系统演化及分类中的地位;任意引物 PCR 可应用多至数百种引物对整个研究对象的基因组进行地毯式的多态性分析,使两个基因组间的微小差异也能被反映出来;该技术使用一套引物可以用于多个物种或群体的遗传多样性研究,这一特点也使得该技术对暴发流行性疾病的调査非常有用,可以迅速査找到传染源,为控制感染争取时间;该法具有常规 PCR 方法具有的简便、快捷,灵敏的特点,且实验成本低。
应用
任意引物 PCR 的常用应用领域如下:
(一)病原菌基因分型与检测
(二)物种亲缘关系鉴定
(三)昆虫学研究
(四)遗传连锁图谱构建
(五)克隆特异基因探针
(六)动物品系鉴定及遗传监测
(七)核心种子资源保存和鉴定
(八)鉴定差异表达基因
来源:丁香实验团队
操作方法
AP-PCR 方法,英文名是 arbitrarily primed PCR,是由 Williams 和 Welsh 同时在 1990 年建立起来的,由于它具有简便、快速,一套引物可用于多个物种的分析,不需预知被检对象的核酸序列和可以显示差异表达基因等特点,已广泛应用于诸多领域。相信随着任意引物 PCR 技术实验重复性和标准化问题的解决,其应用潜力必将得到进一步的开发,成为分子生物学和分子遗传学研究
RAP-PCR 方法RAP-PCR 方法,英文名是 RNA arbitrarily primed PCR fingerprinting,是 AP-PCR 不限于基因组指纹分析,用于 RNA 指纹分析的方法。
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