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用于 PCR 的模板 DNA 制备实验

实验分类:

DNA 实验

最新修订时间:

简介

模板 DNA 质量直接影响 PCR 结果,是 PCR 成功的关键之一。根据其检测对象(组织细胞材料)的不同,有不同的制备方法,常用的材料有石蜡切片、冰冻切片、血细胞、胸腹水等。


来源《免疫组织化学实验技术及应用》


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来源:丁香实验

操作方法

酚-氯仿法提取石蜡组织中 DNA

1. 10 mm 厚石蜡切片 10~15 张,置入消毒后的 1.5 ml Eppendorf 管中。2. 脱蜡 二甲苯 1200 μl,9000 r/min,8 min×3。3. 脱水无水乙醇 1200 μl,9000 r/min,5 min×3。4. 打开 Eppendorf 管盖子,将其置于 37℃ 烤箱中干燥 1~2 h。5. 加裂解液 100μl,混匀后加 20 mg/ml 蛋白酶 K 1

改进的石蜡切片 DNA 提取方法

1. 5 μm 厚的石蜡切片 5 至 10 张贴在干净的载玻片上,常规烘片,脱蜡,水化,蒸馏水清洗,无菌蒸馏水浸泡,取出晾至半干。2. 无菌尖头刀片刮下,放入 300~900 μl 组织裂解液中,并加入 20 mg/ml 蛋白酶 K(PK)10~15 μl,封口膜封口,置 55℃ 3 h 以上。3. 其间用指轻弹离心管以利裂解。若有沉淀,再加入 5~10 μl 蛋白酶 K,直至无沉淀已澄清为止。4

直接法(DNA 免提法)

1. 标本太少时,可将一张石蜡切片经脱蜡,水化,蒸馏水清洗,无菌蒸馏水浸泡,取出晾至半干。2. 加入 20~80 μl 直接裂解液中,加 20 mg/ml 蛋白酶 K 0.2~1 μl,放置 55℃ 裂解 3 h 以上;100℃10 min 灭活蛋白酶 K;10000 r/min 离心 10 min,直接用上清液作模板 DNA。(直接组织裂解液配制:TE 中加入 0.1% Tween-20 或 5

冰冻片(用于 PCR 的模板 DNA 制备实验)

1. 将 10 μl 冰冻切片直接放入含组织裂解液的离心管中。 2. 无菌尖头刀片刮下,放入 300~900 μl 组织裂解液中,并加入 20 mg/ml 蛋白酶 K(PK)10~15 μl,封口膜封口,置 55℃ 3 h 以上。 3. 其间用指轻弹离心管以利裂解。若有沉淀,再加入 5~10 μl 蛋白酶 K,直至无沉淀已澄清为止。 4. 灭活蛋白酶 K 裂解液中含有蛋白酶 K,需放入沸水中 10

含血标本

1. 3 ml 外周血或 1 ml 骨髓液放入含 50 μl 0.5mol/L EDTA 的无菌离心管(15 ml 管)中。2. 2000 r/min 离心 10 min。吸去血浆,用指弹匀剩余的有核细胞和红细胞,加入红细胞溶解液 10 ml 并混匀,常温下放置 30 min。红细胞溶解液配制:NH4Cl 4 g,NH4ClO4 3 g,NH4HCO3 0.04 g,加水定容至 1L;灭菌;4℃

胸腹水或尿液

1. 标本 10 ml 以上,2000 r/min 离心 10 分钟,倒去上清液。用指弹匀沉淀物,加入适量组织裂解液,37℃ 下放置半小时以上。2. 无菌尖头刀片刮下,放入 300~900 μl 组织裂解液中,并加入 20 mg/ml 蛋白酶 K(PK)10~15 μl,封口膜封口,置 55℃ 3 h 以上。3. 其间用指轻弹离心管以利裂解。若有沉淀,再加入 5~10 μl 蛋白酶 K,直至无沉淀

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