常用的连锁分析方法有家系连锁分析法[对数优势记分法(Logoddsscore,LOD)]、患者同胞对分析法和患者家系成员分析法(affectedpedigreemember,APM)。ASP和APM均为非参数分析方法,是性状―模型非依赖性分析,同常用的LOD连锁分析 连锁分析的方法对于直接寻找疾病相关基因来说,仍是不可或缺的基本手段。尽管许多新的工具和方法的提出,使这一过程变得越来越简单化,然而这一基本战略却贯穿于始终。目前常利用微卫星和SNP作为连锁分析的主要方法。进行连锁分析
,经GENESCAN 3.0软件处理后转换成图像文件,再经过GENOTYPER 2.1软件分析后得到每个样本不同位点的基因型结果。将每个样本不同位点的基因型结果按其在染色体上的位置依次排列,并结合其表型做成数据文件,利用LINKAGE软件包(5.1版本)中的MLINK程序进行两点连锁分析。房颤是完全外显的显性遗传的,因此LOD计算时疾病基因频率设为0.001。单倍型分析采用手工计算。通过连锁分析,结果却很失望,LOD值小于1.o。经反复搜寻原因后发现,该家系里有部分后代是非直系的或无血缘关系的,最终收集的具有家系
病 leukemia 库 library 键、连接 linkage 部位、场所 locus 优势对数评分 LOD score 淋巴细胞 lymphocyte M 畸形 malformation 描图 mapping 标记 marker 黑色素瘤 melanoma 孟德尔 Mendel, Johann (Gregor) 孟德尔遗传 Mendelian inheritance 信使RNA messenger RNA (mRNA) [分裂]中期 metaphase 微阵技术
申海鹰 周元国(第三军医大学野战外科研究所分子生物学中心,重庆400042)摘要 疾病基因的分离和克隆 是功能学的研究热点,具体策略的选择取决于疾病背景资料的掌握程度,为能快速、准确地克隆 出目的基因,本文介绍两类常用的基因克隆 策略――定位克隆 策略、功能策略――及其主要方法,如:家系连锁分析、等位基因共占法、人群相关分析法、抑制性消减杂交、差示反转录PCR、差异消减显示法、代表性差异分析法、比较杂交等,并作简要的评价。关键词 基因;定位;消减杂交Strategies and methods