实验室小助理夏奇
宏基因组测序测出了一种近年刚发现的菌(简称a),与医院血培养结果不同(简称b)。
ab属于同一菌属,怀疑是鉴定使用的质谱数据库没有纳入a菌才测出了相似的b菌?
那要怎么验证a排除b?常规方法肯定是没法鉴别出这两种了,本来打算做FISH但a的RNA序列没有特异性做不了。只有组织切片检材。
a807989061
利用mNGS技术为临床揪出致病的“元凶”,还依托多技术平台,根据临床诊断需求加做抗体和Sanger测序。可以以Sanger测序、qPCR、全基因组测序(WGS)和数字PCR等多种分子检测技术为主,联用抗原抗体等方法进行验证
土井挞克树
还是做基因分析吧,分析二者的核酸差别。
loveliufudan
如果宏基因组测序结果与医院血培养结果不同,可以考虑使用其他分子生物学技术来鉴定a菌和b菌。可以尝试使用菌系特异性PCR,根据已知特异性序列与a、b菌进行比对。如果有其他已知特异性序列可用,也可以考虑进行随机扩增子测序(RAPD)或靶向扩增子测序(T-RFLP)。此外,组织切片检材也可以用于观察菌的形态学特征,帮助识别不同菌株。
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