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实验小白一个,GST pull down应该如何下手?是否有专门的GST标签载体?载体如何构建?

相关实验:GST 融合蛋白的亲和纯化实验

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dxy_yn5g3wy9


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3 个回答

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土井挞克树

有帮助

GST载体构建步骤:

一、从目标组织中提取RNA,并反转录形成cDNA序列

二、设计引物


1.打开tair网站,寻找目的基因的CDS序列,并复制序列, 在snapgene中打开;


2.在最终目标载体书中找到多克隆位点,并寻找只在目标载体中,而不在目的基因片段中的两个酶切位点,通过snapgene添加合适的5’—3’两端引物,并在引物上添加所选酶的片段



三、构建中间载体


1.得到引物后,用cDNA序列和引物进行PCR,获得目的基因的片段,构建中间载体

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于小鱼鱼1998

有帮助

GST的第一步就是构建专门的标签载体,可以直接购买,也可以去载体设计网站进行设计。

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loveliufudan

有帮助

进行GST pull-down实验时,你可以按照以下步骤进行:

1. 购买GST标签载体:GST标签通常与质粒载体一起购买。GST标签质粒是经过改造的质粒,其中包含GST基因序列,允许将GST蛋白与目标蛋白相互结合。

2. 构建GST融合蛋白表达质粒:将你感兴趣的目标蛋白的编码序列与GST基因序列连接起来,构建GST融合蛋白表达质粒。这可以通过标准的分子生物学技术,如PCR扩增、限制酶切和连接,或使用基因克隆技术来完成。

3. 将GST融合蛋白表达质粒转化至大肠杆菌(E. coli)等宿主细胞:使用化学方法或电穿孔方法将质粒转化至宿主细胞中。转化后的细胞可以在含有适当选择抗生素的琼脂平板上进行筛选。

4. 培养宿主细胞并诱导GST融合蛋白的表达:在适当的培养条件下,培养转化后的细胞,并添加适当的诱导剂(如IPTG)来诱导GST融合蛋白的表达。

5. 收集并裂解细胞:收集培养的细胞,使用细胞裂解缓冲液使细胞裂解,并释放出GST融合蛋白。

6. 选择亲和层析材料:选择合适的亲和层析材料,例如GST结合树脂(如Glutathione-Sepharose),将其预先平衡。

7. GST pull-down实验:将细胞裂解液与预先平衡的GST结合树脂进行孵育,使GST融合蛋白与树脂结合。随后,通过洗涤步骤去除非特异性结合的蛋白,并收集目标蛋白与GST融合蛋白复合物。

8. 分析:通过Western blot、质谱分析等方法检测目标蛋白与GST融合蛋白的相互作用。

关于GST标签载体的获取和构建,你可以购买商业化的GST标签质粒(例如pGEX系列质粒)作为起点。这些质粒已经含有GST基因序列,并提供了适当的限制酶切位点,便于连接你感兴趣的目标蛋白。你可以使用标准的分子生物学技术(如PCR、酶切和连接)来构建GST融合蛋白表达质粒。

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