P65和pp65都下调了，说明什么。

可以认为是抑制了nfkb通路，但是建议再检测一下通路中的p50等，并且更换内参不能用total的p65 当内参了，可以考虑beta-actin或gapdh

说明抑制表达了，可以做内参进行实验

在细胞给药后，p65和pp65的剂量依赖性下调，可能说明化合物抑制了NF-κB的表达或活性。

p65是NF-κB家族的一个亚基，其存在可以激活NF-κB通路，导致其转录活性上升，进而调控细胞内多个信号通路和炎症反应。pp65是p65的一种磷酸化修饰形式，磷酸化状态可以影响p65的转录活性。如果化合物能够抑制NF-κB通路的表达或活性，那么p65和pp65的表达量和磷酸化状态都会受到抑制，从而呈现剂量依赖性下调的趋势。

至于您的第二个问题，建议您不要以p65作为内参，因为内参应该是稳定表达且不受处理影响的蛋白质。在您的实验中，因为化合物抑制了p65的表达或活性，所以它不再是一个适当的内参。您可以考虑使用其他稳定表达的蛋白质，如β-actin、GAPDH等作为内参。