IP实验阴性对照组IgG有目标条带，但是由于我的蛋白带有V5标签同时曝光V5阴性对照则没有条带，而用目的蛋白的抗体阴性对照有条带

可能是抗体非特异识别IgG，用标签蛋白就好了

这个好像我也遇到过。可以增加蛋白量，改善实验条件，比如加大一抗浓度。

可能你的目的蛋白的抗体可以非特异的识别igG，或者是你目的蛋白正好在轻链或重链的位置，被识别了