酵母双杂交Y2H在四缺培养基上有自激活的话，意味着就是自激活吗？

是的是的。一般检测自激活就是将已知基因构建到可以表达BD结合结构域的载体上，表达形成融合诱饵蛋白（bait），将目标基因构建到可以表达AD激活结构域的载体上，表达形成融合猎物蛋白（prey）。如果诱饵蛋白和猎物蛋白发生互作，BD结合结构域和AD激活结构域在空间上极为接近，GAL4转录因子发生重构，恢复了转录因子的功能，可以激活报告基因的表达。通过检测报告基因的表达与否，从而推测猎物蛋白和诱饵蛋白是否发生相互作用。