丁香实验_LOGO
登录
提问
我要登录
|免费注册

系统进化树问题,如何确定相关序列?

相关实验:蛋白定量技术

user-title

哇哈哈哈321

想请问1000条以上的氨基酸序列,同源性较差用什么软件建树比较好,MEGA不行,大概是序列太多,总显示内存不足,求前辈帮帮忙吧!

wx-share
分享

3 个回答

user-title

dxy_gwrp7ndq

有帮助

NCBI 、DNAMAN 、DNAStar 、Bio edit 均可构建进化树

user-title

府宅

有帮助

FastTree可计算上千条,还给出了每个节点的可信度

user-title

洛噜啦噜啦嘞

有帮助

可以用MUSCLE 先再比对下, http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/

再MEGA试, 过短和过长的序列都不要, 选 pairwise deletion 参数

提问
扫一扫
丁香实验小程序二维码
实验小助手
丁香实验公众号二维码
扫码领资料
反馈
TOP
打开小程序