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系统进化树问题，如何确定相关序列？
哇哈哈哈321
想请问1000条以上的氨基酸序列，同源性较差用什么软件建树比较好，MEGA不行，大概是序列太多，总显示内存不足，求前辈帮帮忙吧！
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3 个回答
dxy_gwrp7ndq
有帮助
NCBI 、DNAMAN 、DNAStar 、Bio edit 均可构建进化树
府宅
有帮助
FastTree可计算上千条，还给出了每个节点的可信度
洛噜啦噜啦嘞
有帮助
可以用MUSCLE 先再比对下, http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/
再MEGA试, 过短和过长的序列都不要, 选 pairwise deletion 参数
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