一个基因有3个转录本，应该选取哪个反转录呢？

天一湖医者

2022-03-24

有帮助

1、带有MANE Select transcript标签，说明在ensemble和NCBI数据库中均认定该转录组是最主要，最保守和最高表达的。选择该转录本即可

2、如无MANE标签，可看 APPRIS，它是相似的评价标准，P1代表最主要最相关的转录本。

3、如无以上标签，可看注释，CCDS显示转录本的编码序列，与ensemble和NCBI数据库相匹配。

迟C迟

2022-03-24

有帮助

基因的转录本选择最可靠的还是看文献。实在没人做过的，一般选最长的最保险。

bamboopiggy

2022-03-24

有帮助

你如果是检测基因的表达量，又不care是哪个转录本，就把检测的primer设置到三个转录本都有的区段，除非你特异性primer的反转录，否则反转录kit里面带的引物是通用的，你不知道会出来哪个。

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