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一个基因有3个转录本,应该选取哪个反转录呢?

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acejandro本尊

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3 个回答

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天一湖医者

有帮助

1、带有MANE Select transcript标签,说明在ensemble和NCBI数据库中均认定该转录组是最主要,最保守和最高表达的。选择该转录本即可

2、如无MANE标签,可看 APPRIS,它是相似的评价标准,P1代表最主要最相关的转录本。

3、如无以上标签,可看注释,CCDS显示转录本的编码序列,与ensemble和NCBI数据库相匹配。

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迟C迟

有帮助

基因的转录本选择最可靠的还是看文献。实在没人做过的,一般选最长的最保险。

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bamboopiggy

有帮助

你如果是检测基因的表达量,又不care是哪个转录本,就把检测的primer设置到三个转录本都有的区段,除非你特异性primer的反转录,否则反转录kit里面带的引物是通用的,你不知道会出来哪个。

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