天一湖医者
1、带有MANE Select transcript标签,说明在ensemble和NCBI数据库中均认定该转录组是最主要,最保守和最高表达的。选择该转录本即可
2、如无MANE标签,可看 APPRIS,它是相似的评价标准,P1代表最主要最相关的转录本。
3、如无以上标签,可看注释,CCDS显示转录本的编码序列,与ensemble和NCBI数据库相匹配。
迟C迟
基因的转录本选择最可靠的还是看文献。实在没人做过的,一般选最长的最保险。
bamboopiggy
你如果是检测基因的表达量,又不care是哪个转录本,就把检测的primer设置到三个转录本都有的区段,除非你特异性primer的反转录,否则反转录kit里面带的引物是通用的,你不知道会出来哪个。
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