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府宅
短期保存（1周内）：
对于短期保存，大多数蛋白可以保存在4 摄氏度下。4摄氏度下保存面临最大的问题是微生物的污染。因此，如果保存时间超过24小时，建议利用0.22 um的滤膜过滤样品，除菌后保存在无菌的管子中。值得注意的是，并不是所有的蛋白质都适合保存在4度下。
长期保存：
对于长期保存，冷冻是必须的。蛋白质溶液在速冻后可以在-20度或-80度中进行，-80度下的蛋白可以保存更长久。长期保存蛋白质的另一个方式是冻干（lyophilization）。蛋白质冻干后会呈现蓬松的白色粉末形式，处于完全脱水的状态，可以在冰箱中无限期保存。然而，对于某些蛋白质，冻干操作有一个潜在问题就是蛋白质不能复溶。冻干／复溶的过程同样会对蛋白质产生一定的伤害作用。
1. 无菌
进行蛋白质操作实验时一定要带手套。实验室中戴手套多是为了保护自己，但在生化实验中，蛋白质却是需要我们保护的对象。我们的皮肤上有一些蛋白酶，这些蛋白酶很可能会降解掉我们的蛋白样品。皮肤上的其他化学分子也可能会污染蛋白样品。另外，为了防止细菌的生长，蛋白质最好保存在灭菌的小管中。
2.避免震荡
震荡产生的剪切力有可能会对蛋白质产生破坏作用。震荡时溶液中会产生气泡，氧气的进入会导致蛋白质处在氧化环境中。蛋白质中含有半胱氨酸，其极易被氧化为胱氨酸，这一过程很可能会破环蛋白质的活性。
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低温下保存蛋白质。
需要尽量减少冻融的次数。纯化后的蛋白质，进行分装保存，每次需要多少便融化多少，保证蛋白质样品只经历一次冻融。
纯化后的蛋白质尽量以高浓度保存，浓度最好在1mg／ml以上，高浓度更有利于蛋白质的稳定。高浓度的另一个好处是防止蛋白质分子黏贴在塑料或玻璃材质的管壁上。尽可能缩短冷冻的过程。速冻可以在液氮中进行，也可以在干冰，乙醇和丙酮的混合物中进行。速冻后，蛋白质可以保存在-20度或-80度中。同样的道理，蛋白质融化的过程也要尽可能的快速，可以在温水中进行。
蛋白质需要保存在合适的缓冲液中。同时缓冲液中还可以添加一些保护剂，比如保存在-20度时，可以添加10%-50%的甘油，这样可以防止蛋白质冷冻，不需要经历冻融。同时还可以添加一些抗菌试剂，比如叠氮化钠（sodium azide），可以防止细菌生长。或者蛋白酶抑制剂（PMSF），抑制蛋白酶对蛋白质的破坏。另外，还可以添加一些还原剂，如DTT，防止蛋白质的氧化。在选择添加剂时，一定要保证所加试剂不会影响到蛋白的活性。
