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请问circRNA的convergent引物怎么设计啊

相关实验:用T4 RNA 连接酶连接 RNA 分子

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天路旅客99

可以直接用线性亲本基因的引物吗

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4 个回答

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沉沦6RZH

有帮助

https://www.sohu.com/a/215186821_802014

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dxyc42u

有帮助

不可以用线性亲本基因的引物,这两个的扩增方式都不一样

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天路旅客99user-title

请问convergent引物怎么设计啊?

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loveliufudan

有帮助

在设计cirCRNA(环形RNA)的convergent引物时,需要考虑以下几点:

1. 引物定位:convergent引物应该定位在环形RNA的两个相对方向的连接点上,确保引物能够扩增整个环形RNA的序列。

2. 引物设计:引物应该具有良好的特异性,避免与线性亲本基因的序列重叠。可以使用引物设计工具如Primer-BLAST、Primer3等,确保引物的特异性和稳定性。

3. 引物长度:引物长度通常在18-25个碱基对之间,较短的引物可能会增加非特异性扩增的风险,而过长的引物可能会导致扩增效率降低。

4. 引物Tm值:引物的熔解温度(Tm值)应该在合适的范围内,一般推荐在50-65°C之间。确保引物的Tm值相近,可以提高PCR扩增的特异性和效率。

需要注意的是,由于cirCRNA与其线性亲本基因具有不同的结构和序列特征,直接使用线性亲本基因的引物可能不适合cirCRNA的扩增。cirCRNA的引物设计需要针对其环形结构进行优化,以确保引物能够扩增环形RNA的全长序列。

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毛利小五郎的徒弟

有帮助

可以直接用线性亲本的引物做,只要特异度好就没问题

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