土井挞克树
可以在circRNA数据库如circBase中进行查找。
进入circBase,输入种属及查询的rna序列就可以选择了
星舟0316
我在circbase种属中只能看到小鼠的,请问大鼠的RNA序列怎么看,有教程吗求分享!
loveliufudan
要找到人和大鼠之间的cirRNA的同源性,可以采用比对序列的方法。首先需要获取人和大鼠的cirRNA序列,可以通过NCBI等数据库查询得到。然后,可以使用基因组比对软件(如BLAST,Bowtie等)将人的cirRNA序列比对到大鼠基因组上,找到大鼠中与之相似的cirRNA序列。此外,还可以通过RNA序列比对软件(如STAR,HISAT2等)比对转录组数据,找到人和大鼠中差异表达的cirRNA序列。总之,通过序列比对可以找到人和大鼠之间的cirRNA同源性,并确定差异表达的cirRNA序列。
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