笑月2016
目前已经知道一段人非编码RNA的序列,如何查找人鼠同源性?我在BLAST上输入了序列,得到了很多结果,但是不太看得懂,跪求大神指点,谢谢!
土井挞克树
需要先确定人非的基因序列然后再进行比较
loveliufudan
在使用BLAST之前,您需要选择合适的数据库,以比对您的人非编码RNA序列。最常用的数据库是NCBI的nr数据库,它包含了许多生物物种的核酸和蛋白质序列。您可以选择含有鼠类数据的nr数据库进行比对。
在BLAST网站上输入您的序列,然后进行比对。得到的结果将包含多个序列的相似性得分,以及它们的详细信息。
您可以通过阅读BLAST结果的比对图,了解哪些鼠类序列与人非编码RNA序列的相似性最高,以及它们的物种信息。您也可以查看每个序列的E-value和位置参数,以确定它们的相似性是否是有意义的。
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