丝状真菌启动子序列查找

请问同学找到预测的方法了吗，我也需要求助

启动子（promoter）是与RNA聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。

UTR（Untranslated Regions)：即非翻译区，是信使RNA（mRNA）分子两端的非编码片段。5'UTR从mRNA起点的甲基化鸟嘌呤核苷酸帽延伸至AUG起始密码子，3'UTR从编码区末端的终止密码子延伸至多聚A尾巴（Poly-A）的末端。

我们经常用万能的PubMed来查找出基因的启动子序列~

可以打开PubMed（网址：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed）

然后我们可以直接在搜索栏进行查找自己想要的基因

一般的常见的真菌数据库里面有，其余你可以上具体论文中查询

可以看看这个，中科院研究开发了一种基于流式细胞的单细胞定量方法来精确评估基因启动子，并以丝状真菌构巢曲霉为模型，表征并构建了包含93个本地启动子的调控元件文库，为丝状真菌启动子的定量表征提供了一种高效的筛选策略，同时也为微生物调控元件的开发提供了新的途径。

查找丝状真菌内的启动子序列，你可以尝试以下方法：

1.使用生物信息学工具：有多种可以根据基因组序列预测启动子序列的工具，例如Promoter2.0、Transfac等。

2.搜索公开数据库：数据库，如GenBank、JGI和真菌基因组数据库（FGD）包含了真菌基因组序列的信息，包括启动子序列。你可以使用与您的具体真菌相关的关键字搜索这些数据库。

3.实验验证预测的启动子序列：在某些情况下，预测的启动子序列可能不准确，因此可能需要实验验证预测的序列。这可以通过5' cDNA末端的快速扩增（5' RACE）、启动子捕获或染色质免疫沉淀（ChIP）等技术来实现。

据我所知，目前好像没有预测真菌启动子序列的特定网站，但使用上述资源应该可以帮助你查找。