赤子红心
有做环状RNA的大神吗?环状RNA反转cDNA时不能用OligoDT引物吗,必须要用特异性引物或随机引物N6吗?环状RNA的引物设计一般在多长为最好?
huarenqiang5
OligoDT引物不能用于环状RNA反转cDNA。环状RNA的引物设计一般为15-25 bp,常用的是18-23 bp,不建议大于30bp,因为过长会导致其退火温度过高,不适于定量PCR反应。
loveliufudan
环状RNA是一种特殊的RNA分子,它们是通过环状结构形成的,而不是线性的。在进行环状RNA反转录成cDNA时,通常需要使用特异性引物或随机引物进行引物导向合成。这是因为Oligo-dT引物只能与线性RNA的3'末端结合,而环状RNA没有3'末端,所以不能使用Oligo-dT引物。
环状RNA的特异性引物设计一般需要考虑多种因素,如环状RNA的结构、序列和表达水平等。通常,引物长度越长,特异性越高,但同时也会增加引物合成和纯化的难度。一般来说,环状RNA特异性引物长度在20-25个核苷酸左右为宜。
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