提问
提问
我要登录
|免费注册

大鼠circRNA预测靶miRNA用哪个软件呀

相关实验:miRNA 克隆实验

user-title

dxy_iff1q1c3

高通量测序出了一些大鼠的circRNA,是新的circ,目前只知道序列和来源基因,怎么去预测其中某个circRNA的靶miRNA,找了好多软件,都是输入circRNAID预测,或者直接网址打不开。救救孩子吧

wx-share
分享

2 个回答

user-title

Dr_劉医生

有帮助

没到用软件那步,先得检索miRNA。推荐数据库cirbank(步骤见图),打开首页后点击miRNA,输入circRNA的ID,点击search,即可。

user-title

dxy_iff1q1c3user-title

但是我测序出的circRNA没有ID,只有具体的序列,和染色体位置

user-title

毛利小五郎的徒弟

有帮助

一般用的是circBase数据库,这个数据库比较全。

user-title

dxy_iff1q1c3user-title

但是,我的是大鼠,没有circRNAID,只有序列和位置

提问
扫一扫
丁香实验小程序二维码
实验小助手
丁香实验公众号二维码
关注公众号
反馈
TOP
打开小程序