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1. Trizol试剂含有苯酚,具有毒性和刺激性,注重操作。
2. RNase污染的主要来源是操作过程中手和空气中的浮沉,注重配带手套,样品尽可能盖严。
3. 细胞裂解必需充分且操作迅速。裂解不完全会降低最后得率,因为一部分RNA会残留在未裂解的细胞中。细胞裂解之后要看不见颗粒状物质(结缔组织和骨除外)。在清洗和裂解细胞时最好在低温下操作,防止在操作过程中释放的内源RNase降解了RNA。
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1.去膜要完全。2匀浆要条件一致。裂解时间可以适当延长。3.sevag抽提水相,2次。
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1.RNA在细胞内极易降解,样本选择时一定要选取新鲜的样本组织或者取样后迅速低温处理(液氮速冻);样本出现多次反复冻融后,RNA得率会严重下降,也会导致RNA降解;RNA提取环境要保持无RNA酶污染;
2.RNA容易受到环境污染导致RNA严重降解,建议实验过程中注意更换实验手套,使用所有耗材应该均无RNA酶的一次性耗材;
3.试剂盒中BufferEB(RNA专用)中含有少量EDTA,可能影响下游实验,使用时适当稀释,如果用其他洗脱液洗脱,要确保PH>7.5,PH过低影响洗脱效率;
4.离心柱漂洗完成后,尽可能烘干柱膜上残留乙醇,残留乙醇会影响洗脱效率和下游实验效果;柱膜也不建议过度干燥,没有乙醇味道残留最好,如果过度干燥可能影响RNA溶解;如果A260/230值过低,说明样本提取过程中漂洗不彻底,有盐离子残留,建议增加漂洗次数;
5.对于RNA提取,A260/280<1.9说明有可能存在DNA污染或者蛋白污染,如果洗脱样本时没有使用BufferEB,而使用ddH20(确保无RNA酶),比值或偏低,因为Ph值会影响吸光值,并不表示样本纯度低;
6.如果提取的样本RNA发生严重降解,可能是由于裂解液没能完全灭活样本中RNA酶,建议增加裂解液使用量(具体参见说明书)或者降低样本初始量;
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1、研磨组织样本时,要避免样本发生冻融,防止样本RNA降解;
2.分层以后,在取上层水相时千万要小心,手不要抖,心不要慌,拿移液枪要稳,吸取上层水相时尽量要缓慢匀速稳定地去吸取液体,枪头也要跟随液面缓缓下移。吸取液体过快,导致液体流动加快从而带动中间层,当吸取到中间层时,可能会导致我们最后提取的RNA有蛋白污染。
3:操作环境干净无灰尘,严格戴好口罩,手套。手指和呼吸是重要的外源酶的来源。所以童鞋们做RNA抽提的时候,还是要全副武装起来。这对自己也是一种保护措施。
4:实验所涉及的离心管,Tip 头,移液器杆,电泳槽,实验台面等要彻底处理。离心管和枪头要用DEPC处理过,单纯的消毒灭菌可不行呀。移液器和实验台面等要用75%的酒精擦过。
5:实验所涉及的试剂/溶液,尤其是水,必须确保RNase-Free。
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