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我想问一下,如果ATG8基因包括两个亚型,其中包括LC3-B,但是在NCBI查不到在大鼠中序列,可以用大鼠中LC3-B的引物检测ATG8的表达嘛?
毛利小五郎的徒弟
不可以用大鼠lc3-b的引物检测atg8,因为lc3-b不具有atg8特异性
loveliufudan
如果在NCBI(National Center for Biotechnology Information)的数据库中无法找到大鼠中ATG8基因的序列信息,那么直接使用大鼠中LC3-B的引物来检测ATG8的表达可能存在一些问题。这是因为LC3-B只是ATG8基因的一个亚型,而ATG8基因可能包含其他亚型或变体。
在这种情况下,建议采取以下措施:
1. 更全面的搜索:尽可能尝试使用其他数据库或资源进行ATG8基因的搜索,例如Ensembl、UCSC Genome Browser等。这些资源可能提供更全面的大鼠基因组信息,以寻找ATG8基因及其亚型的序列。
2. 系统命名:确保你使用的术语和命名是正确的。检查是否有其他命名方式或代表ATG8基因的名称。有时,不同的研究可能使用不同的命名约定。
3. 保守性序列:如果已知其他物种(如人类)中有LC3-B的序列信息,并且ATG8基因在物种之间具有高度保守性,那么可以考虑设计引物以检测ATG8基因的保守区域。在设计引物时,确保引物的特异性和特征与ATG8基因的保守区域相匹配。
4. 测序验证:如果以上方法都无法获得确切的ATG8基因序列信息,可以考虑使用测序技术对该基因进行直接测序,以获取准确的大鼠ATG8基因序列。
dxyc42u
不可以,万一ATGB基因发挥功能的另一个亚型就惨了
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