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细胞条形码,数字PCR

相关实验:反向 PCR (inverse-PCR)

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随便避尘

请问各位大佬,有没有人是搞测序方面或者数字PCR的,想请教一个问题,就是细胞条形码怎么应用到dPCR里做检测的,想了好久都想不出来怎么搞

 
 
 
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2 个回答

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土井挞克树

有帮助

你可以简单理解为条形码是细胞的标签,可看作一段特异序列,以此为参考设计引物做dpcr

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loveliufudan

有帮助

下面是一种可能的方法,将细胞条形码应用于dPCR的检测过程:

细胞条形码的设计:首先,需要设计一组细胞条形码序列。这些序列可以是一系列特定的DNA序列,每个细胞都有唯一的条形码。细胞条形码的设计可以使用基因合成技术或者其他方法来生成。

细胞条形码引物的设计:为了将细胞条形码引入到dPCR反应中,需要设计与条形码序列相匹配的引物。这些引物可以用于扩增和检测细胞条形码序列。

细胞的裂解和dPCR反应:将待检测的细胞裂解,释放其中的核酸。然后,将细胞核酸与细胞条形码引物一起进行dPCR反应。dPCR反应会将细胞核酸扩增成数目巨大的拷贝,并在每个反应中分割成许多小份。

条形码的读取和分析:对于每个dPCR反应,可以使用测序技术或者其他方法读取条形码序列。通过分析每个反应中条形码序列的组合和数量,可以推断出每个细胞的基因表达水平。

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