sswei
使用R包homologene来查找不同种属间的同源位点选择。
loveliufudan
构建基因修饰小鼠时,确定同源位点的选择需要考虑多个因素,包括但不限于以下几点:
研究目的:首先需要考虑你的研究目的是什么。如果你希望在小鼠中研究某个特定基因的功能,那么你需要选择与该基因同源的位点。如果你希望研究某个进化上保守的基因功能,则需要选择在不同物种中高度保守的区域。
同源性:需要对比不同物种的基因组序列,确定同源区域。对于常见的小鼠(Mus musculus)和人(Homo sapiens)等物种,可以通过基因组数据库如NCBI、ENSEMBL等进行比对。在比对过程中,需要考虑到基因组序列的变异程度、同源区域的大小和位置等因素。
保守性:选择保守性较高的位点可以提高修饰效率和稳定性。通过比对多个物种的基因组序列,可以确定某一位点的保守性程度。
可操作性:在选择同源位点时需要考虑到该区域是否容易进行基因编辑,如是否容易设计引物、是否有限制酶切位点等。
土井挞克树
可以上ncbi网站上输入相关基因然后寻找不同种属的同源位点
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