原来是小鹿呀
病毒某个基因的全基因一直扩增不出来,用的引物是一位师姐发表的引物,同源性也很高,但不知道为什么扩不出来,扩增用的酶是Kod one(这个毒的GC含量很高),有没有大佬知道是为什么呀,已经扩增两个月了
huarenqiang5
考虑以下几点原因:引物没有设计好、模板浓度过低、温度过高等。
loveliufudan
扩增不出目标基因可能有多种原因,以下是一些可能导致扩增失败的原因和可能的解决方法:
引物的问题:即使同源性高的引物也可能有问题,例如引物设计不合理、引物浓度过高或过低、引物与模板DNA结合不良等。您可以尝试调整引物浓度或更换其他的引物来扩增目标基因。
模板DNA的质量:模板DNA可能受到污染或降解,导致扩增失败。您可以重新提取模板DNA或尝试使用商业化 DNA 提取试剂盒来提取 DNA。
PCR反应体系的问题:如果PCR反应体系中的某些组分存在问题,例如PCR反应缓冲液、dNTPs、酶等,也会导致扩增失败。您可以尝试更换反应缓冲液、dNTPs、酶等来解决问题。
扩增条件的问题:扩增条件可能不适合目标基因的扩增。例如,反应温度、扩增周期数、引物浓度、酶浓度等条件可能需要进行优化。您可以尝试使用不同的扩增温度、周期数等条件来优化PCR反应。
模板DNA的量:如果模板DNA的量太低,也会导致扩增失败。您可以尝试增加模板DNA的量来解决问题。
扩增酶的问题:Kod One是高GC含量的模板DNA的PCR酶,但是如果它不能成功扩增您的目标基因,您可以尝试更换其他的PCR酶来解决问题。
最后,我建议您再次检查您的PCR反应体系、扩增条件和实验操作,以确定是否存在可能影响扩增的问题,并逐一排除这些问题。
毛利小五郎的徒弟
先少量扩增一下,看是否是酶的关系,如果可以排除酶的原因那么还是体系条件设置的不对。
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