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SYBR Green 的qPCR产物长度对结果的影响,求助🆘

相关实验:反向 PCR (inverse-PCR)

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羽毛毛毛毛毛毛毛

用的是SYBR Green的方法做的qPCR,内参基因产物条带大小是600,目的基因是250左右,不知道这两个不一样会不会对结果有影响。

也看了一些讨论有的说有影响有的说没有只跟基因拷贝有关,自己理解的如果SYBR Green染料在每一个DNA双链螺旋的小沟结合,那600的长度每条扩增的肯定比250的荧光染料结合的多吧?感觉好像会减少达到阈值的循环数。

(自己的理解的,但是在想是不是指数扩增数量猛地增高,所以可以无视600比250多的一点点的荧光染料?就像过大可以趋近于♾️那样理解?)

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4 个回答

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行而上学不行

有帮助

太大严重影响扩增效率,一般为70-200bp.

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羽毛毛毛毛毛毛毛user-title

扩增效率会影响结果ct值么。

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juyue2010

有帮助

会有影响,qPCR中,基因片段最高不超过250bp,否则会影响扩增效率,

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简简单单的8872

有帮助

是的,内参600和目的250确实有差异,荧光阈值也会有差异,但是既然有内参,你最后测定的是相对值(目的/内参),应该是同一批实验条件一致即可。另外内参为何不选的小一些,对qPCR来说600有些大了些

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羽毛毛毛毛毛毛毛user-title

引物不是自己设计的,是从别的文章down下来的,后来才发现这么大。不过这样看来对实验结果应该不会有影响咯?

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土井挞克树

有帮助

指数扩增的时候的确会接近于无穷大,所以荧光可忽略。

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