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q-pcr验证高通量测序结果,结果为啥反复横跳?

相关实验:实时荧光定量 PCR(realtime PCR)

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柒小落丁香园

q-pcr比较空白和模型组的某个基因表达,结果和测序结果总是反复,重现性差,今天做出来了,明天又做不出来,条件什么的都尽量保持一致了,这样的结果可靠吗?

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6 个回答

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汤姆卜丽波

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这样的结果是不行的,三次独立重复的话。每次都要提RNA之后测浓度,必要时还要跑胶防止降解

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dxywode

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请问cDNA是如何保存的,有可能是cDNA时间过长降解了。

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秋秋欣欣

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结果反复肯定是不可靠的,建议用不同的样本,做三次独立重复看看。

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Eason老歌迷

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有几种原因。可能是你没有用同一批样品来检验;或者你的样品有污染、核糖体污染——转录组的基因表达量计算有误;做QPCR验证的基因表达量偏低,差异不显著;两种方法本身存在差异,出现不一致情况也正常(40%左右)。

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天一湖医者

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有可能是cDNA时间过长降解了。

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bamboopiggy

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为什么要qcpr验证呢?就是因为测序结果也可能不准,如果你在所有条件都最优化的情况下,还做不准,可能就是这个基因的表达有问题

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