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跑荧光定量pcr 曲线有双峰,primer设计引物分数是满分,求大神给个建议。

相关实验:逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR,rtpcr)

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菊花与白鹤

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6 个回答

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balalaLy

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如果是主峰前面出峰,一般是引物二聚体,如果是后面,可能是非特异扩增,可降低引物浓度,退火温度和镁离子浓度

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Eason老歌迷

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是不是引物二聚体,你做个阴性对照(只加引物,不加模板)就知道了。不过看峰的位置,是非特异的扩增,与你的引物或者cDNA有关,你已经试过了多种退火温度都没有改善,说明它影响不大。cDNA反复冻融,容易降解,尤其是浓度比较低的时候;引物可以换另一种引物尝试做。

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Junego

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1.primer设计的引物分数是针对引物扩增的评价,没有二聚体、错配或发卡结构,所以你得到的分数比较高。

2.设计好的引物建议去比对一下,可以用NCBI等网站blast,分析引物特异性。

3.设计qpcr引物,推荐NCBI,首页最下面有个primer-blast,可以设置不同长度和产物等条件的引物,关键是能够通过选择物种保证引物特异性。

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天一湖医者

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荧光定量pcr 曲线有双峰,你做相对定量了吗,将样品结果与对照看看基因表达量分析就可以了! 如果绝对定量,需要进一步实验吧!

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汤姆卜丽波

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双峰说明还是特异性不高,有引物二聚体,可以再换一个低一点的试一下

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bamboopiggy

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你说的是melt curve是双峰吧,这说明你的pcr产物不是单一产物,虽然软件给你是满分,但是你去blast一下看看,是不是还有别的结合?

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