关于碱性琼脂糖凝胶电泳
千羽晓梦
我正在重复这一篇文章的内容Biotechnological mass production of DNA origami（10.1038/nature24650），提取噬菌体中的单链DNA，但是在结果验证的过程中涉及到碱性琼脂糖凝胶电泳，但是我们实验室不常用这个实验，我想问一下，单链DNA是否应该严格采用这种方法？一般的实验步骤可以找到参考书，但是各种试剂有那个公司提供的比较专业，并且可以保证技术咨询？另外有人称实验可能还有条带消失情况出现的原因？如果有做过的大神还请赐教，因为这方面好像资料不多
3 个回答
sswei
碱性琼脂糖凝胶电泳能够使DNA 保持单链状态，根据其分子大小在碱性琼脂糖凝胶中泳动。
千羽晓梦
感谢，我还有一个疑问就是作者在图中有单链DNA和双链dna在一张图上，那么单链dna在常规的琼脂糖电泳中能得到结果吗
土井挞克树
单链DNA建议使用碱性琼脂糖凝胶电泳，可以分离到大小片段，取得良好的电泳结果。
事实上影响最终结果的因素很多，胶的浓度，电压，ph等细节都会产生影响，一般公司都会提供技术援助
千羽晓梦
可以使用常规电泳方法代替吗，还是只能使用碱性电泳，
loveliufudan
单链DNA在凝胶电泳中的迁移速度和行为与双链DNA不同，因此需要使用适当的凝胶体系和电泳条件来获得清晰的结果。通常，使用较低浓度的琼脂糖凝胶（例如0.8-1%琼脂糖）和碱性缓冲液（例如Tris-borate-EDTA缓冲液，TBE）来实现更好的分离效果。
在选择试剂和供应商时，可以根据实验需求和预算进行选择。一些常见的供应商提供DNA凝胶电泳试剂和相关产品，这些公司通常提供质量良好的试剂，并且提供技术咨询和支持。
关于条带消失的情况，可能有几个原因：
1. 样品处理问题：DNA可能会被过度酶解、降解或者存在其他物质的干扰，导致条带消失。确保样品处理过程中避免酶解和降解，并清洁样品以避免污染。
2. 电泳条件问题：电泳过程中的电流、电压和电泳时间等参数可能需要调整，以确保DNA可以适当地迁移并被准确检测。优化这些条件可能有助于解决条带消失的问题。
3. 染色问题：染色剂可能会影响DNA的可视性。确保使用适当的DNA染色剂，并按照说明书的建议进行染色。
