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求助 | 细胞彗星实验protocol

相关实验:彗星实验在环境毒理学中的应用实验

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xy812828022

文献里的实验方法都不是很详尽,实验室里也没有师兄师姐做过,求好心人分享,万分感谢

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3 个回答

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dxyc42u

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细胞彗星实验主要步骤

1.单细胞悬液制备

(1)悬浮细胞:细胞悬浮液经离心分离获得。将细胞以1×105个/ml的速度悬浮于1X PBS(不含Ca+和Mg+)中。


(2)贴壁细胞:轻轻从皿底分离细胞。将细胞和培养基转移到离心管中,进行细胞计数。用1X PBS (不含Ca+和Mg+)冰洗一次。将细胞以1×105个/ml的速度悬浮于1X PBS(不含Ca+和Mg+)中。


(3)组织制备:称取组织约0.05 g,加入制备缓冲液(含20 mmol/L EDTA-Na2的PBS)立即剪碎,冲洗。迅速研磨组织,过滤,整个过程在冰上操作。离心重悬,计数单细胞悬液密度约在为1×105~4×105个/mL。


2.制片、裂解、解旋及电泳

(1)取120μL浓度为电泳胶A趁热铺于磨砂载玻片上,形成底胶,用盖玻片推匀,不能有气泡,4℃凝固20min。


(2)水平取下盖片,取80 μL电泳胶B与20μl细胞悬液混匀,立即铺片,加上盖玻片,4℃凝固5min,形成第二层胶。再取80μL电泳胶B铺在第二层胶上,4℃凝固5min,形成第三层胶。保证细胞均匀分布于每孔,每个样本平行2孔。


(3)细胞裂解


将玻片置于平皿中,加入预冷的裂解液(裂解液:DMSO=10:1),4℃过夜裂解,裂解液平面刚好没过玻片表面。裂解后,倒掉裂解液,用超纯水清洗3次,5min/次。


4、解旋


加入预冷的解旋液(pH>13)没过玻片,4℃避光解旋1h。


5、电泳


预先将电泳槽置于冰盒内,冷却备用。将解璇后的细胞玻片置于电泳槽,倒入电泳液,调整电压 22-24V,电流约为300Ma,电泳20min。电泳结束后,取出玻片,轻轻擦拭,去除多余液体。


超纯水清洗2遍,无水乙醇脱水1遍,5min/次。37℃烘干。


3.染色、拍照及分析

染色时将稀释过的Gene Red : Tris-Hcl 1:6000,加到玻片每孔表面,每孔100μL,避光染色30分钟。超纯水清洗3遍,去除多余液体,37℃烘干或室温避光晾干。


拍照前关闭实验室光源,使用CASP1.2.3beta2彗星图像分析软件进行分析,每只动物都要分析150个可分析的尾DNA含量百分率的中位数。分析过程中如遇刺猬细胞进行标记。

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loveliufudan

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以下是一般的细胞彗星实验(Comet Assay)的基本步骤和协议:

1. 培养细胞:选择合适的细胞系,并按照适当的培养条件培养细胞。

2. 细胞处理:根据实验需求,处理细胞,例如暴露于DNA损伤剂(如紫外线、化学物质等)或其他刺激。

3. 细胞收集:收集细胞,可以通过常规的细胞收获方法(如胰酶消化、细胞离心等)将细胞从培养皿中收集。

4. 细胞凝胶电泳:将细胞悬浮在低熔点琼脂糖(Low-melting agarose)中,然后将混合物均匀涂在预涂盖玻片上。等待琼脂糖凝固。

5. 细胞裂解:在细胞凝胶上加入细胞裂解液,以裂解细胞膜和细胞核,并释放DNA。

6. 碱性电泳:将裂解的细胞在碱性缓冲液中进行电泳。这将导致DNA碱解成碱基片段,形成彗星形状。

7. 中和:将碱性电泳后的样品在中和缓冲液中进行中和,以稳定DNA的碱性断裂。

8. 染色:使用DNA染色剂(如SYBR Green)染色,以增强彗星形状的可视化。

9. 彗星图像采集和分析:使用显微镜和图像分析软件,对彗星形状的DNA进行图像采集和分析。可以评估彗星尾长、尾百分比、DNA损伤程度等指标。

需要注意的是,具体的细胞彗星实验协议可能会因实验目的、细胞类型和实验条件的不同而有所变化。建议在设计和执行实验时参考相关的研究文献和专家建议,以获取更具体和适合的细胞彗星实验协议。

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毛利小五郎的徒弟

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实验步骤


将细胞加PBS,冲洗1次,离心后将细胞浓度调整为106~107个/ml,立即进行以下步骤。


(1) 胶板的制备


① 第一层胶的制备:将已预热56℃的80μl 0.5%正常熔点琼脂糖NMA(溶于无Ca2+,Mg2+的磷酸缓冲液PBS)滴到同样预热的载玻片的磨砂面,迅速盖上干净的盖玻片,4℃放置10min使其凝固。


② 第二层胶的制备:取10μl含1000个细胞的PBS和75μl 0.5%低熔点琼脂糖LMA(溶于无Ca2+,Mg2+的磷酸缓冲液PBS)在37℃混匀,然后轻轻揭去盖玻片,将含细胞的LMA滴到第一层胶板上,立即盖上干净的盖玻片,4 ℃ 放置10min使其凝固。


③ 第三层胶的制备:最后在凝固的LMA层上滴加85μl预热37 ℃ 的0.5% LMA,盖上盖玻片,使其凝固。第一层胶的主要目的是使第二层平整和附着紧密,第三层胶的目的是对第二层细胞起保护作用。


(2) 细胞裂解 移去盖玻片,将载玻片浸入新配置的细胞裂解液中至少裂解1h(在放第一片开始计时,再以同样的顺序取出,确保每张片子裂解时间相同)。此步骤的目的是溶解细胞膜及核膜,除去蛋白质、RNA等,仅存留核骨架。


(3) DNA碱解旋 细胞裂解后,取出载玻片,用PBS冲洗2次,以去掉载玻片表面高浓度的盐,然后将载玻片置于水平电泳槽中,倒入新配置的碱性电泳缓冲液,约覆过胶面0.25cm。碱解旋20min,以便使DNA在碱性条件下解螺旋形成单链DNA,使DNA断链,在电泳场中易于迁移。


(4) 单细胞电泳 在25v、300mA条件下电泳20min。


(5) 中和与染色 电泳完毕后,将载玻片取出,滤纸吸干电泳缓冲液,用Tris-HCl(pH7.5)中和15min。然后每片载玻片上滴加50μl 30μg/mL的溴化乙锭(EB)溶液,避光操作,盖上盖玻片,避光染色20min,即可观察。


(6) 试验结果观察与数据处理 EB染色后的样本尽快在荧光显微镜下观察并拍照电泳图谱。①计算拖尾率,并利用统计软件SPSS 10.0进行X2 检验。② 对每张组织片子的细胞,利用Comet Assay Software Pect (CASP 1.2.3 beta 1) 图像分析软件 对彗星图像进行指标分析,用 X(—) ±SE表示彗星全长( CL) 、尾长( T L) 、尾矩( TM) 和Olive 尾距( OTM),并利用统计软件SPSS 10.0分析,显著性比较采用t 检验。

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