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【求助】药物处理后细胞凋亡,但RT-PCR结果显示c-myc上调,结果奇怪?

zhilan1985 我用抗肿瘤药物处理后细胞发生了凋亡,但是RT-PCR结果显示原癌基因c-myc表达上调,文献上在其它细胞实验中显示有下调的,有不改变的。感觉结果有些奇怪,请问在抗肿瘤细胞生长的情况下,有可能会使c-myc表达上调吗?还望了解c-myc的高手帮忙解答下,谢谢!doctormy zhilan1985 wrote:我用抗肿瘤药物处理后细胞发生了凋亡,但是RT-PCR结果显示原癌基因c-myc表达上调,文献上在其 ...

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【求助】求助:如何证明两种受体间存在竞争性抑制

杨春勇 我想证明两种跨膜蛋白受体之间存在竞争性抑制,但不知道应用何种方法,两者的分子结构也不知在那里可以查到,请热心人给与指点,谢谢!freecell 哪个跨膜蛋白的受体啊?toddy99 如果你不知这两个受体的downstream的话,(就是说你无法通过检测下游effector的激活来看),最直接的方法是做IP受体,在表达和不表达另一个竞争受体的条件下,通过标记你的ligand,看是否存在对ligand本身的竞争。但是受 ...

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【求助】请问现在用哪种促细胞凋亡药效果比较好的

旺仔小馒头天字号 小女正在动物身上造模,需要一个促凋亡的模型,请问大侠们哪些促凋亡药物效果好点呢,可否推荐些常用的促凋亡药物呢fsq6666 化疗药,如紫杉醇。ikewei 阿霉素 很容易引起经典的凋亡本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】求靶基因预测软件

山大真大 :):):)我最近在做一个ncRNA 的项目,希望大家能给我提供几款靶基因预测的软件我自己找过很多但都下不下来。。。最好能顺便提供教程zhujoker 呵呵,ncRNA可是一个大范围啊?你需要什么样的靶基因预测的软件?你做的是什么ncRNA,能否说的明确一点?山大真大 TargetScan miRanda DIANA2MicroT PicTar这之类的软件我在网上找的都不能用十分希望您能帮帮忙……zhujoker 直接在网上预测啊,好 ...

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【求助】Mean SLR和meanCPV是什么意思?

青翠林木 Mean SLR和meanCPV在图中用红圈标出了,不知道是什么意思,它们越大越有意义,还是相反呢?想从中挑一个基因出来,不知挑哪个freecell SLR: Signal log ratiosCPV: Change P-value由文献得知,这是Affymetrix公司提供的某个参数。自己去看吧,上面说得很清楚。http://www.affymetrix.com/support/technical/whitepapers/sadd_whi ...

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【求助】请教基因的专业术语PAPP-A IVS6+ 95(G/C)和 rs13290387意思

苦难医生 请教做分子生物学的战友,本人是临床医生,在看篇外文文献,是关于PAPP-A 基因多态性的研究,在实验中提到PAPP-A IVS6+ 95(G/C)PAPP-A IVS6+ 95(G/C)和 rs13290387,我大约知道是这个基因95位的G/C多态性,但IVS6表示什么意思就不知道,另外rs no代表什么意思也想不起来,是基因库的序号吗?请战友给以解释,谢谢wxbing rs13290387 是一个SNP可在NCBI直接查询版主freecell留 ...

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【讨论】考考你的判断力:2篇关于microRNA的文章,是不是简单重复?

zhujoker 2篇文章,美国人做的。1.The Oncogenic microRNA-27a Targets Genes That Regulate Specificity Protein Transcription Factors and the G2-M Checkpoint in MDA-MB-231 Breast Cancer Cells。2.Oncogenic microRNA-27a is a target for anticancer agent methyl 2-cyano-3,11-dioxo-18b-o ...

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【求助】转录调控的问题请教

skmaple 本人最近正在做:一个蛋白A是否可以与一个基因B的启动子区域结合,并且上调B启动子的活性。现在的问题是A蛋白经验证是存在于细胞内(胞浆及胞核)的一种蛋白,那么我在研究A蛋白是否可以结合到B的启动子区域并且增强B启动子的活性的时候,是否需要外源性转染构建的携有A的真核表达载体?还是说选用一个天然不表达A蛋白的细胞,然后再外源性转染携有A的真核表达载体?还是说细胞本身就表达A蛋白,这个时候就不需要外源 ...

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【求助】如何有目的地突变镰刀菌等真菌内的某个基因?

gggchilly 想有目的地突变镰刀菌内的某个基因,有没有什么良策啊?包括合适的载体等等,急,不胜感激。也可以发我邮箱gggchilly @ yahoo.com.cnamberly 你要看看是什么菌种,然后在google上搜索该菌的isogenic mutation, vector,plasmid等关键词。一般地,如果该菌是可转化的话,应该是有发表的方法的。做法是把抗性基因(如Ampicillin)插入到你的目的基因内,然后转化某穿梭 ...

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【求助】有没有工具能够针对某一特定片段(3'UTR)预测与其作用的microRNA

allshine 各位目前有没有工具能够针对某一特定片段(3'UTR)预测与其作用的microRNA?因为我最近在做3'UTR上的一个突变,想确认这个点突变是否会引入一个新的microRNA作用靶点,而常用的预测软件好像都是针对一个大的基因或者microRNA来进行预测的,所以如果有战友以往有过类似的经验的话请指教。谢谢zhujoker 这个软件倒是真的没有见过,不过你可以把你的序列用RNA22这个软件和一些你认为 ...

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【求助】关于siRNA设计

caroline0701 我最近要设计几对化学合成的siRNA,在网上看了一些资料,想请问一下siRNA的结果该怎么分析啊?Max score, Total score, Query coverage, E value, Max ident 都是什么意思?谢谢大家的指导!预祝大家国庆节快乐中秋快乐freecell 不同的算法有不同的评价参数。不给出具体信息,难以判断。caroline0701 Target sequence 24: AATCTTTGGAAGAACTACCA ...

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【讨论】请教:一个亚基促进另一个亚基表达

pyjnuedai 小弟在实验中发现,我正研究的一个由多亚基组成的复合物,其中一个亚基在细胞中的过表达能够明显促进另一个亚基在细胞中的过表达,即:实验组(plasmid B + plasmid A)和对照组(plamid B + empty vector of plasmid A)相比,B的表达量明显增强,约高出两个数量级。请教各位,不知道这样的现象可不可能具有什么生理学意义?有哪些可能的方向对此进行进一步的研究。谢谢大家!!freecell 不知道是什么蛋白质, ...

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【求助】如何利用文献的引物明确扩增序列的位置

Cherrybei 请问如何利用文献所提供的引物,来明确PCR扩增序列的位置,我利用Pubmed上的Blast,好像只能看到比对的结果是在哪一个染色体上,却不能知道扩增的序列是在哪一个外显子上,因此不能确定目标基因的SNP是否在扩增的序列上。期待高手们的指点,非常感谢!!!:)lmnsmu 我认为不应该与整个核酸库进行比对,你应该先找到你的目的基因序列,然后再用文献的引物去比对,确定扩增片段在那个区域。一点愚见,仅供参考。 ...

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【求助】有使细胞表达某种蛋白下降的质粒

28810789 请问有使细胞表达某种蛋白下降的质粒吗?如果有这种质粒,那么它与RNA干扰(siRNA)有什么区别?谢谢!freecell shRNA就是以质粒形式,转染细胞后使某种蛋白表达下降的。其与siRNA区别见图。vitrogene shRNA能使蛋白质下调的质粒,它主要是用来建稳转细胞株,而siRNA却不可以.版主freecell留言:请不要发布隐形广告!本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及 ...

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【求助】求助nf-kb荧光素酶报告基因和EMSA问题

00501101 1、nf-kb荧光素酶报告基因nf-kb质粒有卖的没?哪家公司啊?或者,请教怎么构建啊,有步骤没,我对构建是一点也不懂,着急啊。2、EMSA:我准备定Pierce公司的核蛋白提取试剂盒、化学发光EMSA试剂盒、NF-kB的探针。但是Pierce公司的尼龙膜要2800,也太贵了吧,有没有便宜点的可以做出结果来的尼龙膜哪个公司可以买,或者卖单张的。erik nf-kb荧光素酶报告基因nf-kb质粒stratage ...

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【求助】请问CDGSH锌指结构域中的“CDGSH”是指什么?

zjhua 请问CDGSH锌指结构域中的“CDGSH”是指什么?lalala_2004 Iron-binding zinc finger CDGSH typeThe CDGSH-type zinc finger domain binds iron rather than zinc as a redox-active pH-labile 2Fe-2S cluster. The conserved sequence C-X-C-X2-(S/T)-X3-P-X-C-D-G-(S/A/T)-H is a defining feature of this fa ...

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【求助】查microRNA 前面的一段基因序列

sunji 我想知道microRNA 前的序列应该怎么查望高人指点zhujoker 就在版块上有一个“如何查找pre-miRNA上下游的序列?”既然上下游都可以,你为什么还要来一个上游怎么查?学习不要只到达目的,而在于你的学习过程。请见下面帖子,可能会对你有帮助的。http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=154&id=15429796&sty=1&tpg=1&age=0vitrogene 找个找到pre-mi ...

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【讨论】外源性的癌基因DNA注入裸鼠就能生癌吗?

xiongsanxiao 比如说一个DNA片段,含癌基因,直接注射入裸鼠体内,它就会表达癌吗?要想使一个外源基因在体内顺利表达,需要哪些条件?高手赐教,洗耳恭听,谢谢。jiachengyou2007 路过 随便谈谈,希望拍砖一般来讲,要想看某癌基因的致癌性,需要把这段基因转到一个载体里,然后转染或感染到细胞里。经过筛选(稳定转染或用流式)后注射到动物体内,观察其是否有致癌性。如果直接把DNA片段注射入裸鼠体内,裸鼠虽无免疫系统, ...

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【求助】**integrin(整合素)的抑制剂是什么啊???

lizhenbang ***integrin(整合素)的抑制剂是什么啊???小弟准备做整合素一系列实验,着急找不到抑制剂是什么啊?谢谢各位大侠!熊文平 拮抗剂,有很多种类,如抗体mayle 整合素分活化和非活化的 当然用不同的抑制剂像STI571dfbsdsdfsd rgd可以抑制integrin本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcomi ...

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【求助】关于正义寡核苷酸、错义寡核苷酸(无意义寡核苷酸)

bahai 大家好,最近看文献,发现了 反义寡核苷酸、义寡核苷酸、错义寡核苷酸(无意义寡核苷酸),我知道反义寡核苷酸技术,但是什么叫义寡核苷酸、错义寡核苷酸(无意义寡核苷酸),查了一下没有搞清楚,请各位老师帮忙解释一下啊,非常感谢!freecell 还是举个例子说明吧。Stat3正义寡核苷酸序列:5’ AGAAACAGGATGGCCCAATGG 3’,即与原始DNA序列的正链;Stat3反义寡核苷酸序列:5’ CCATTGGGCCATCCTG ...

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