超抗原与TCR和MHC分子的结合

蛋白质抗原必须经过加工和提呈才能被T细胞识别，然而超抗原在激活T细胞之前无须加工和处理，因而具有两个不同点：一是激活T细胞的超抗原为完整的抗原分子而不是抗原肽；二是超抗原一般不进入MHC分子的抗原结合槽。这两点决定了超抗原和TCR／MHC发生相互作用时构成的三元体。

与经典形式的三元体不同。超抗原分子位于TCR和MHC分子的外侧，一端和TCR日链相连，另一端和APC表面的Ⅱ类分子相连。细菌性超抗原(如SE、TSST-1)主要与TCR口链的第二互补决定区(CDR2)结合，部分结合CDRl和CDR4两个区段。

病毒性超抗原(如MMLV)主要结合CDR4。这样，在抗原肽识别中占重要地位的TCRa链和口链的CDR3，一般不参与超抗原的激活.