不同浓度竟争模板和控制混合液的配制
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EP管号 |
竟争模板gGM浓度 (ng/μl) |
用量 |
1 | 10.0 | 10μl |
2 | 1.0 | 10μl |
3 | 0.8 | 10μl |
4 | 0.6 | 10μl |
5 | 0.4 | 10μl |
6 | 0.2 | 10μl |
7 | 0.1 | 10μl |
8 | 0.08 | 10μl |
9 | 0.06 | 10μl |
10 | 0.04 | 10μl |
11 | 0.02 | 10μl |
12 | 0.01 | 10μl |
13 | 0.001 | 10μl |
(1)不同浓度的竞争模板和控制混合液的配制,(每管体积均为10μl);
(2) 标准混合液的制备:GM―CSF上游引物(5nmol/ml)48μl,GM―CSF下游引物48μl,dNTP贮备液(2.5mmol/L 每种浓度)96μl,(GM―CSF cDNA(0.6μg/μl 12μl),1 0×PCR缓冲液120μl,Taq DNA聚合酶(5 U/μl)1.2μl,双蒸水756μl;
(3) 向竞争模板GM-cSF 1#~11#管中加入90μl上述混合液;
(4) PCR进行40个循环,参数为94℃ 1min,62℃ 1min,72℃ 2min;
(5) 取反应液各20μl,一式三份,在2.5%琼脂糖凝胶中电泳分析;
(6) 测定每管中(gGM)和cGM的含量,以密度计对电泳胶片进行分析测定;
(7) GM―CSF/GM―CSF cDNA对已知竞争GM―CSF量的函数作图。在比例为1:1的等值点处cGM=gGM。据此,可判断未知cDNA的浓度。
基因组GM-CSF与cDNA扩增后的比率与加入反应中原始基因组DNA的关系(图中显示0.1-1.0ng的范围)