丁香实验_LOGO
登录
提问
我要登录
|免费注册
点赞
收藏
wx-share
分享

内切酶PCR反应中的活性

互联网

2509

 

酶切反应条件如下:在20 µl PCR产物混合体系中加入5U的内切酶,按相应的反应温度温育1小时。通常20 µl PCR产物体系中含有1 µg底物DNA,1单位的Vent DNA聚合酶,1× ThermoPol Buffer [10 mM KCl, 20 mM Tris-HCl (PH 8.8@25°C),10 mM (NH4 )2 SO4 , 2 mM MgSO4和0.1% Triton X-100],以及终浓度为200 µM的dNTPs。表中标记有的内切酶在酶切反应前需加入NaCl(终浓度为100 mM)或相应的10× NEBuffer(1×终浓度)。

注意:在非最佳条件下进行酶切反应容易出现星号活性。要避免星号活性或希望取得更好的酶切效果,则需用乙醇沉淀纯化DNA,再将其溶解于相应的酶切缓冲液。此外,如果使用不纯的DNA聚合酶,会因其中混有其它核酸酶而影响整个反应结果。

+++表示完全切割;++表示约50%被完全切割;+表示约25%被完全切割。

 

在反应物中的活性
Aat II  + + + 
Acc I 
Acc65 I  + + 
Aci I  + + + 
Acl I  + + 
Afl II  + + + 
Afl III  + + 
Age I  + + + 
Ahd I  + + 
Alu I  + + + 
Alw I  + + 
AlwN I  + + 
Apa I  + ++ 
ApaL I  + + + 
Apo I  + + 
Asc I  + + + 
Ase I 
Ava I  + + + 
Ava II  + + 
Avr II  + + + 
Bae I none
BamH I  <center> + + +</center>
Ban I  + + + 
Ban II  + + + 
Bbs I  + + + 
Bbv I  + + 
Bcg I  + + 
BciV I + + 
Bcl I  + + + 
Bfa I  none
Bgl I 
Bgl II  + + + 
Blp I  + + + 
Bmr I <center> <font>+ + +</font></center>
Bpm I  + + 
Bsa I 
BsaA I  + + + 
BsaB I  + + 
BsaH I  + + + 
BsaJ I  + + + 
BsaW I  + + 
BseR I  + + + 
Bsg I  + + 
BsiE I  + + 
BsiHKA I *  + + 
BsiW I  + + 
Bsl I + + 
Bsm I  + + + 
BsmB I  + + 
BsmF I  + + 
BsoB I  + + + 
Bsp1286 I  + + + 
BspD I  + + 
BspE I *  + + + 
BspH I  + + 
BspM I  none
Bsr I  + + + 
BsrB I  + + + 
BsrD I  + + 
BsrF I  + + 
BsrG I  + + 
BssH II  + + 
BssK I  + + 
BssS I  + + + 
BstB I  + + + 
BstE I  + + + 
BstN I  + + 
BstU I  + + 
BstX I  + + + 
BstY I  + + 
BstZ17 I  + + 
Bsu36 I  + + + 
Btg I <center> <font>+ + +</font></center>
Bts I <center> <font>+ + +</font></center>
Cac8 I  + + + 
Cla I  + + 
Dde I  + + + 
Dpn I  (none, requires methylated substrate) 
Dpn II  + + + 
Dra I  + + 
Dra III *  + + + 
Drd I  + + 
Eae I  + + + 
Eag I 
Ear I  + + + 
EcoN I  + + 
EcoO109 I  + + + 
EcoR I  + + 
EcoR V  + + + 
Fnu4H I  + + + 
Fok I  none
Fse I  + + + 
Fsp I  + + 
Hae II  + + + 
Hae III  + + + 
Hga I  + + + 
Hha I  + + 
Hinc II  + + 
Hind III  + + + 
Hinf I  + + 
HinP1 I  + + + 
Hpa I  + + + 
Hpa II  + + + 
Hph I  + + + 
Kas I  + + + 
Kpn I  + + + 
Mbo I  + + 
Mbo II  + + + 
Mfe I  + + 
Mlu I  + + 
Mly I <center> + + +</center>
Mnl I  + + + 
Msc I  + + 
Mse I  + + 
Msl I  + + + 
Msp I  + + + 
MspA1 I  + + + 
Mwo I  + + 
Nae I 
Nar I  + + 
Nci I  + + 
Nco I  + + + 
Nde I  + + 
NgoM IV  + + 
Nhe I  + + 
Nla III  + + + 
Nla IV  + + + 
Not I  + + + 
Nru I  + + 
Nsi I  + + + 
Nsp I <center> + + +</center>
PaeR7 I  + + 
PflF I  + + 
PflM I  + + 
Ple I  + + 
Pme I  + + 
Pml I  + + 
PpuM I  + + 
PshA I  + + 
PspG I <center> + +</center>
Pst I  + + + 
Pvu I  + + 
Pvu II  + + + 
Rsa I  + + + 
Rsr II  + + 
Sac I  + + 
Sac II  + + + 
Sal I * 
Sap I  + + 
Sau3A I  + + + 
Sau96 I  + + 
Sca I  + + 
ScrF I  + + + 
SexA I <center> <font>none</font></center>
SfaN I  + + 
Sfc I  + + + 
Sfi I  + + + 
Sfo I <center> <font>+ + +</font></center>
SgrA I <center> <font>+ + +</font></center>
Sma I  + + 
Sml I  + + + 
SnaB I  + + 
Spe I  + + + 
Sph I  + + + 
Ssp I  + + 
Stu I  + + 
Sty I  + + 
Swa I <center> + + +</center>
Taq I  + + 
Tfi I  + + + 
Tli I <center> + + +</center>
Tse I  + + + 
Tsp45 I  + + + 
Tsp509 I  + + + 
TspR I  + + 
Tth111 I  + + 
Xba I  + + + 
Xcm I  + + + 
Xho I  + + 
Xma I  + + 
Xmn I  + + + 

 

 

 

提问
扫一扫
丁香实验小程序二维码
实验小助手
丁香实验公众号二维码
关注公众号
反馈
TOP
打开小程序