寡核苷酸微阵列法
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寡核苷酸微阵列法
该方法以已知CpG岛的序列分别设计能够与甲基 化和非甲基化CpG岛片段杂交的寡核苷酸探针微阵列,用于同时分析众多已知CpG位点的甲基化状态。样品基本处理步骤如下:DNA经MssI(酶切位点是GTTT)消化后用亚硫酸氢钠处理,再在酶切位点的粘性末端加上接头,用通用引物进行PCR扩增、荧光素标记、微阵列杂交及扫描。该方法的优点是能直接得到目标CpG岛的甲基化信息。缺点是有这种合成的芯片容量不是很大,目前只能检测约80个CpG岛的甲基化状态,需要进一步发展。