各种各样的「组学」定义
吉凯
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今天科学的行话变得越来越难以理解了，在进入蛋白质组的大舞台之前，需要了解一些定义。先从一些与公认的传统有冲突的概念开始，这些概念秘密地潜入了现代科学的前沿阵地。
生物学粗糙的术语，或者太多的「组学」(omks）把人们引向「荒诞」(comics）。
全能的上帝给了人们现在的「组学」
基因组学——所有能找到的基因。
转录组学——所有那些行动自由自在的信使们（估计超过 100 000 个）。
蛋白质组学——国王的所有子民和他所有的战马（一支军队：估计 1 000 000 个）。
代谢组学——所有前述的这些大分子遭天罚后的少数幸存者(只有一小撮，估计仅有 2000 个）。
系统组学――所有上述组学的混合
即使消化了这些古怪的术语（如基因组学、蛋白质组学和代谢组学）还是不够的，人们还需要囫囵吞枣地接受这样一个荒诞的术语 ——「系统组学」，就像隆美尔（Rommel）的军队出现在荒凉沙丘的骆驼脊背上一样，不用恐惧。
很多这样的名词开始出现在人们的视线中，如「糖组」、「复合物组」和类似的词语。然而，正像增加巴别塔（Babel）的混乱一样，又出现了更多钻牛角尖的定义：Jeremy Nkh01son（个人通信）坚持在metabolomks（代谢组学） [细胞代谢（cellularmetab01ism）]和 metabonomics（代谢组学）[完整系统代谢(intact systems metablism)]之间有显著的区别。
也许他们都是对的，但是谁能够把人们从「荒诞」中解救出来?
功能蛋白质组学的概念
关于在细胞分化、增殖和信号传导过程中蛋白质表达的变化的描述，不管是定性还是定量，都属于功能蛋白质组学的范畴。它也包括对基因协同表达的研究和一个细胞或个体在其整个生命周期中各个阶段的调控事件发生顺序的阐明。
结构蛋白质组学的定义
结构蛋白质组学的目的是鉴定分子的结构，即参与某个指定过程的蛋白质整体的氨基酸序列，并把这种信息和基因库相关联。使蛋白质组学发生了革命性变化的最强大的方法是质谱分析。
人蛋白质组清单的估计
一个细胞的蛋白质组：5000 条多肽。
一个人瞬时的蛋白质组：106 条多肽。
一个人整个生命周期的蛋白质组：107 条多肽。
一个人种的蛋白质组：108 条多肽。
以上数值是根据人的基因组中大约存在 45 000 个基因估计的。
现代基因组／蛋白质组分析中还未解决的问题
- 一个细胞中有多少基因是被激活的，哪些基因是被激活的?
- 合成了多少种多肽，它们的量各有多少?
- 在一个合成的蛋白质上发生了哪种翻译后修饰?
- 蛋白质分子的半寿期是多少，它又是如何影响蛋白质的功能的?
- 蛋白质跨区域转运遵守什么样的规则?
