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核酸突变检测技术

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基因突变是指由于DNA碱基对的置换、增添或缺失而引起的基因结构的变化,亦称点突变。
它的分类方式包括1)根据基因结构的改变方式,基因突变可分为碱基置换突变和移码突变两种类型;2)根据遗传信息的改变方式,基因突变又可以分为同义突变、错义突变和无义突变三种类型。
基因突变的检测方法:从基因突变的性质来看,检测方法分为显性突变法、隐性突变法和回复突变法三类。
广义的突变?


检测可以从两个层次来入手:一个是蛋白质层次的间接检测,主要是借助一些蛋白质分析技术,分析突变体产生的变异蛋白,以及由变异蛋白引起的其他改变,比如从菌落形态,抗生素抗性等来入手;
二是可以对遗传物质(主要是DNA)的直接检测,一般来说,这类技术是通过建立一系列电泳,分析DNA 构象或解链特性,或者利用DNA 变性和复性等特性,来进行DNA 突变的分析。目前由于PCR 技术的应用,基因突变检测主要以分析DNA 变异的直接检测为主。以下是直接基因突变检测时可以使用的策略:
1 。单链构象异构多态分析技术( Single-strand conformationpolymorphism,SSCP)
2。异质性双链构像多态性分析(Heteroduplex,HTX)
3。变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Get Electrophoresis, DGGE)
4。错配裂解法(Dismate cleavage,DC)
5。变性高效液相色谱分析( Denaturing high-performance liquidchromatograph, DHPLC)
6。毛细管电泳(Capillary electrophoresis, CE)
7。碱基切割序列扫描(Base Exicision Sequence Scanning BESS)
8.等位基因特异性寡核苷酸杂交(ASOH0
9。等位基因特异性扩增(ASA)。
蛋白和mRNA检测均可以反应突变水平,杂交或RT-PCR是否可以检测基于基因扩增的突变?


关基因突变的检测,我补充几点:
一、直接基因突变检测方面
1 .在单链构象异构多态分析技术( Single-strand conformationpolymorphism,SSCP)中又可分以下几种:
RNA 单链钩象多态性检测(PCR-rSSCP)
双脱氧测序单链片段构象多态性分析(PCR-ddF)
限制性内切酶指纹技术(PCR-REF)
2 .在错配裂解法(Dismate cleavage,DC)中又可分为酶错配裂解法(Enzyme mate cleavage, EMC)和错配化学切割法(Chemical cleavage mate,CCM)二种。
3.测序(Sequencing):测序对突变的检测准确,但耗费人力、物力较多。随着人类基因组计划的不断深入,很多高效、快速的测序方法被开发应用。在大规模突变检测中,多重PCR 测序和利用基因芯片测序,有良好的应用前景。
4.引物延伸(Primer Extension, PEX):引物延伸的原理是将引物合成到突变点前一个碱基,然后与基因组DNA 退火,分别于两管中加入一种同位素或非放射性标记的野生型和突变型的互补碱基,使各自的引物得以延伸一个或几个碱基,经电泳鉴定该碱基是否已掺入,从而分别判断是属于野生型还是突变型。

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