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培养细胞中RNA检测-Northern Blot

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培养细胞中 RNA 检测- Northern Blot

1. 制胶:( 1 %)

琼脂糖 2.5g

10 × Mops 缓冲液 25.0ml

H2 O 192.0ml

2. 在微波炉中加热煮沸使胶完全溶于水并灭菌。

3. 取出胶冷却到 60 ℃,于通风柜中加 45ml 甲醛,混匀。

4. 20 μ l 溴化乙锭,混匀。

5. 令胶液再冷却 10 分钟。

6. 将其倒入四面封好的电泳槽中,加样品梳,约 20 分钟形成电泳凝胶。

7. 加入 1 × Mops 缓冲液于电泳槽,盖满胶表面,但不 >1cm

8. 10 15 μ g RNA 样品,真空离心干燥,再溶于 20 μ l 载样缓冲液,加热 95 2 分钟,使 RNA 变性。

9. 每孔中 20 μ l RNA 点样,同时加一标准物。

10. 一般 35V 电泳,从下午 4pm 9 30am

11. 取出胶在紫外灯下观察,将刻度尺放在胶旁照像。成功的电泳在胶上 28S (约 5kb 18s (约 2kb )处可见明显的溴化乙锭带。

12. 500ml 10 × SSC 浸泡洗涤胶 2 次,每次 20 分钟,去除甲醛。

13. 其它吸印步骤完全与 Southern Blot 相同,只是吸印缓冲液为 10 × SSC

14. 室温下至少吸印 12 小时。

15. 吸印完成后,取出胶与滤膜,表明加样起始部位、膜的方向及标号、用 Whatman 滤纸包好, 80 ℃真空干燥 2 小时;如为尼龙膜在紫外灯下照射 5 分钟。

16. 分子杂交:杂交原理与 Southern Blot 相同,但所用杂交液及杂交、洗涤温度与之不同。预杂交液制备:

50 甲酰胺

1 SDS

1M NaCl

10 硫酸葡聚糖

17. 将滤膜放入塑料袋,加入 10ml 预杂交液,去除气泡后封袋,在 42 ℃水浴中振荡至少 6 小时。

18. 制备变性鱼精 DNA 100 μ g/ml ,变性同位素标记的探针(加入袋中的终浓度≤ 10ng/ml 1 4 × 105 dpm/ml )。

19. 将此液 0.5 1ml 以针头注入含预杂交液的塑料袋中,排除气泡,从针眼处重新封死塑料袋,再用玻棒在袋上赶几次,使探针与预杂交液充分混匀, 42 ℃振荡水浴 6 42 小时。

20. 膜的洗涤:

a. 2 × SSC 100ml 室温中振荡 5 分钟,共 2 次。

b. 1 SDS 2 × SSC 200ml 60 ℃振荡 30 分钟,共 2 次。

c. 0.1 × SSC 100ml 室温振荡 30 分钟,共 2 次。

21. 膜在室温中自然干燥后,用塑料纸包好即可进行放射自显影过程(同 DNA 检测)。

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