质粒的酶切鉴定及片段回收
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主要应用于质粒 的酶切鉴定。10ul反应体积中含1mg DNA,酶切反应体系如下:
质粒 DNA 1mL
10×缓冲液 1mL
两种限制酶各 0.5mL +0.5mL
双蒸去离子水 7mL
总体积 10mL
[操作方法]
按下列顺序加入试剂:
(1)在一灭菌的新的Ep管中加入7ul双蒸水。
(2)加入10×缓冲液1mL 。
(3)加限制酶Kpn I 0.5mL,Sac I 0.5mL。
(4)最后加入质粒 DNA lmL。
(5)稍离心,混合。
(6)37℃水浴1—1.5h。
(7)取出后电泳分析鉴定是否酶解。
[注意事项]
(1)双蒸水为可变体积,当其它反应成分确定后,用双蒸水将反应体积补足。
(2)质粒 DNA最后加入,以防止操作不当引起试剂的污染。
(3) 大多数限制酶均加50%甘油缓冲液置于-20℃保存,其活力,稳定,但在配制反应混合物时,酶的加入量要准确限制小于总体积的l/10,否则甘油会抑制酶解反应。
二、冻溶法从琼脂糖凝胶中回收DNA
在重组DNA或探针标记等实验中,常常需要从凝胶中回收和纯化DNA,常用的回收方法有:压碎浸泡法、透析袋洗脱法、低熔点琼脂糖法和DEAE—纤维素膜法等。
[操作方法]
(1) 从琼脂糖凝胶中将含有拟回收DNA片段的胶块切下,置于Ep管内。
(2) 用一次性注射器将胶由针头处挤入Ep管内,加等体积Tris平衡酚混匀后,置液氮10min。
(3) 取出离心,5000g,5min。
(4) 小心地将水相转移至另一Ep管中。
(5) 加等体积酚:氯仿(1:1)充分混匀。离心,5000g,5min。
(6) 将水相转移Ep管中,加等体积氯仿:异戊醇(49:1)充分混匀。
(7) 离心,5000g,5min。
(8) 在转移出的水相中加1/10体积3mol乙酸钠(pH5.2)和2.5倍体积的预冷的无水乙醇置-30℃30min。
(9) 离心,12000g,15min.
(10)弃上清,加预冷的70%乙醇1ml,12000g,离心5min。弃上清,室温放置数分钟。
(11)将沉淀用20ul TE缓冲液(pH8.0)溶解,-20℃保存备用。