siRNA
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<font><font>siRNA </font> </font>
Small interfering RNA
是一种小RNA分子（~21-25核苷酸），
由Dicer（RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶）加工而成。
<font>SiRNA</font> 是siRISC的主要成员，激发与之互补的目标mRNA的沉默。
越来越多的研究人员开始采用
小分子干扰RNA（small interfering RNAs，siRNAs)
来抑制特定的哺乳动物基因表达。
<font>siRNA</font> 是一种短片断双链RNA分子，
能够以同源互补序列的mRNA为靶目标降解特定的 mRNA，
这个过程就是RNA干扰途径（RNA interference pathway）。
<font>siRNA化学合成</font>
尽管化学合成是最贵的方法，但是却是最方便的——研究人员几乎不需要做什么工作。
主要的缺点包括价格高，定制周期长，特别是有特殊需求的。由于价格比其他方法高，
为一个基因合成3—4对siRNAs 的成本就更高了，
比较常见的做法是用其他方法筛选出最有效的序列再进行化学合成。
最适用于：已经找到最有效的<font>siRNA</font> 的情况下，需要大量<font>siRNA</font> 进行研究 不适用于：筛选<font>siRNA</font> 等长时间的研究，主要原因是价格因素.。
<font>siRNA表达载体</font>
多数的<font>siRNA</font> 表达载体依赖3种RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种，
操纵一段小的发夹<font>siRNA</font> 在哺乳动物细胞中的表达(1–4)。
这3类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U6启动子和人H1启动子 。
之所以采用RNA pol III启动子是由于它可以在哺乳动物细胞中表达更多的小分子RNA，
而且它是通过添加一串（3到6个）U来终止转录的。
要使用这类载体，
需要订购2段编码短发夹RNA序列的DNA单链，
退火，克隆到相应载体的pol III 启动子下游。
由于涉及到克隆，这个过程需要几天的时间，
同时也需要经过测序以保证克隆的序列是正确的。
不过幸好载体容易大量扩增，这个优点足以弥补所有缺陷，
特别是当载体在实验中确实有效的时候。
毫无疑问，
<font>siRNA</font> 表达载体的优点在于这是众多方法中唯一可以进行长期研究的方法——
带有抗生素标记的载体可以在细胞中持续抑制靶基因的表达，持续数星期甚至更久。
即使是对转染带有筛选标记质粒的细胞进行瞬时筛选，也有助于富集带质粒的细胞。
这也可以帮助解决一些难转染的细胞由于转染效率低造成的问题。
最近多个厂家开始研究逆转录病毒和其他病毒载体用于<font>siRNA</font> 表达，
其优势在于可以直接高效率感染细胞进行基因沉默的研究 ，
避免由于质粒转染效率低而带来的种种不便。
最适用于：已知一个有效的<font>siRNA</font> 序列，需要维持较长时间的基因沉默，
或者需要用抗生素筛选能表达<font>siRNA</font> 的细胞。长期研究。
不适用于：筛选<font>siRNA</font> 序列
（其实主要是指需要多个克隆和测序等较为费时、繁琐的工作）
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