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从蛋白质中间进行酶切反应

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如果你去大剧院看戏迟到了,而你的座位又在一排当中,越过许多人是否很麻烦呢?如果你的座位碰巧在一排座位两端是否问题就解决了呢?对于26S 蛋白酶 体来说,它就要经过那么一个过程,将未折叠的底物从它们的末端进行消化。但这个模型却不能解释所有 蛋白酶 体催化的事件,现在Liu and colleagues在Science Express上报道,确实有一些蛋白酶底物能被从中间进行切割。

研究者首先比较了两个天然无序的生理性底物p21和a-synuclein和稳定的GFP被潜在的关闭20S蛋白酶体和活性的开放蛋白酶体26S进行降解的过程。其中20S是蛋白酶体的核心,26S是20S蛋白酶体加上PA700的调控性帽子所形成的。

他们发现p21和a-synuclein能有效的被20S和26S蛋白酶体进行降解,而GFP在两种条件下都不被降解。20S的蛋白酶体不能降解短的肽段,但它能有效的降解p21和a-synuclein的现象说明,未折叠蛋白自身就能开放某些活性的酶切位点,使得蛋白酶体能够有效的接近进行酶切。

接下来研究者研究了GFP与这两种蛋白进行融合后的降解反应。当GFP被融合在p21和a-synuclein的氨基端或者是羧基端时,他们吃惊的发现20S和26S蛋白酶体能够还能有效的切割p21和a-synuclein却留下了完整的GFP肽段。当他们在p21和a-synuclein的两端都接上GFP时,他们还是发现20S和26S蛋白酶体能够特异性的对p21和a-synuclein进行酶切,这说明它们识别的内部的蛋白酶作用位点。

Liu and colleagues认为这说明20S和26S蛋白酶体能够有效的对未折叠蛋白的内部酶切位点进行识别,这种蛋白酶反应可能是直接从蛋白质的中间进行的。

相关文章及链接:

ORIGINAL RESEARCH PAPER

Liu, C. W. et al. Endoproteolytic activity of the proteasome. Science Express 2002 December 12 (DOI: 10.1126/science.1079293) | PubMed |

FURTHER READING

Weissman, A. M. Ubiquitin and proteasomes: themes and variations on ubiquitylation. Nature Rev. Mol. Cell Biol. 2, 169-178 (2001) | Article | PubMed |

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