微量RNA的抽提RNeasy MinElute Spin Column(QIAGEN)
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抽提微量RNA的柱子最大可以吸附45ug 的RNA。
·为了更好地裂解,细胞数不能大于5×105,细胞过多会减低产率和纯度。
准备工作:
1.在 24 ml 96-100%乙醇 中加入 6 ml 去RNA酶的水。
2.在每 1 ml Buffer RLT 中加入10 ml β-ME (加入β-ME的Buffer RLT可在室温下放置1月)。
3. Buffer RPE中加入4倍体积的96-100%乙醇。
4.在 550 ml 的去RNA酶的水中加入1500 Kunitz单位的DNA酶1,轻轻翻转试管混匀,勿振荡(溶好的DNA酶1分装后,-20℃可放置9个月,2-8℃可放置6周)
5.当细胞数少于5000个,须在匀浆前在溶液中加入载体 RNA。
首次用时,在1ml 去RNA酶的水中加入 310 ug 载体RNA,则载体RNA的浓度为310 ug/ul,置-20℃保存。
实验时所需浓度为4ng/ul,配制如下:取5 ul 浓度为310 ug/ul的载体RNA,加入34 ul Buffer RLT,吹打混匀,再取 6 ul 稀释液加入54 ul Buffer RLT,得终浓度4 ng/ ul,加5ul到第3步的溶液中。
微量RNA的抽提
步骤:
1.收集细胞:300×g离心5 min( 离心管 自备),沉淀细胞,仔细吸去上清液。
2.加入Buffer RLT分散细胞。轻敲 试管 将沉淀弄分散,加入350 ul Buffer RLT振荡或吹打混匀,
·当细胞少于1×10 5 ,Buffer RLT可用75ul (可用小管),振荡1 min 混匀,接第4步。
3.匀浆细胞:
细胞数少于5000个时,加20 ng 载体RNA ( 4ng/ul 溶液 5 ul),到溶解液中。
3a 在柱子中加入溶解液,置于2ml收集管中,以最大速度离心2min;
4.加入1倍体积的(约350 ul)70%乙醇 到匀浆的液体中,吹打混匀(勿离心),
·若匀浆的液体有所丢失,相应地减少70%乙醇的量,
·若第2步中用了75ul的Buffer RLT,则只用75 ul 70%乙醇。
5.将样本(包括可能形成的沉淀)加入到柱子中(柱子放在一个2ml的收集管中),轻轻盖上管盖, 8000×g ( or 10000rpm)离心15s,弃掉过滤到收集管中的液体。收集管继续用
6.加入350 ul的Buffer RW1 到柱子中,轻轻盖上管盖,8000×g(or 10000rpm)离心15s洗柱子,弃掉收集管中的液体,接第8步。
7.在70 ul Buffer RDD中加入 10 ul DNase 1溶液,轻轻翻转 试管 混匀。(勿振荡)
8.吸起上述 80ul 混合液加入柱子中的硅胶薄膜上,室温放置15min。(勿加到管壁上)
9 吸350ul Buffer RW1 到柱子中, 8000×g(or 10000rpm)离心15s,弃掉收集管及收集管中的液体。
10.将柱子转到1个新的2ml 收集管中,加500 ul Buffer RPE 到柱子中,轻轻盖上 试管 8000×g(or 10000rpm)离心15s洗柱子,弃掉收集管中的液体,收集管再用。
11.加500 ul 80%乙醇 到柱子中,轻轻盖上管盖,8000×g(or 10000rpm)离心2 min 以使硅胶薄膜干燥,弃掉收集管及收集管中的液体。(柱子不要碰到收集管中的液体)
12.将柱子转入1个新的2ml 管中,打开盖子,以最大速度离心5min,弃掉收集管和管中的液体。
13.将柱子转入1个新的1.5ml 的EP管中,加14 ul 去RNA酶的水到硅胶薄膜上,轻轻盖上盖子,以最大速度离心1min,将所得RNA溶液做逆转录或保存。
·为了更好地裂解,细胞数不能大于5×105,细胞过多会减低产率和纯度。
准备工作:
1.在 24 ml 96-100%乙醇 中加入 6 ml 去RNA酶的水。
2.在每 1 ml Buffer RLT 中加入10 ml β-ME (加入β-ME的Buffer RLT可在室温下放置1月)。
3. Buffer RPE中加入4倍体积的96-100%乙醇。
4.在 550 ml 的去RNA酶的水中加入1500 Kunitz单位的DNA酶1,轻轻翻转试管混匀,勿振荡(溶好的DNA酶1分装后,-20℃可放置9个月,2-8℃可放置6周)
5.当细胞数少于5000个,须在匀浆前在溶液中加入载体 RNA。
首次用时,在1ml 去RNA酶的水中加入 310 ug 载体RNA,则载体RNA的浓度为310 ug/ul,置-20℃保存。
实验时所需浓度为4ng/ul,配制如下:取5 ul 浓度为310 ug/ul的载体RNA,加入34 ul Buffer RLT,吹打混匀,再取 6 ul 稀释液加入54 ul Buffer RLT,得终浓度4 ng/ ul,加5ul到第3步的溶液中。
微量RNA的抽提
步骤:
1.收集细胞:300×g离心5 min( 离心管 自备),沉淀细胞,仔细吸去上清液。
2.加入Buffer RLT分散细胞。轻敲 试管 将沉淀弄分散,加入350 ul Buffer RLT振荡或吹打混匀,
·当细胞少于1×10 5 ,Buffer RLT可用75ul (可用小管),振荡1 min 混匀,接第4步。
3.匀浆细胞:
细胞数少于5000个时,加20 ng 载体RNA ( 4ng/ul 溶液 5 ul),到溶解液中。
3a 在柱子中加入溶解液,置于2ml收集管中,以最大速度离心2min;
4.加入1倍体积的(约350 ul)70%乙醇 到匀浆的液体中,吹打混匀(勿离心),
·若匀浆的液体有所丢失,相应地减少70%乙醇的量,
·若第2步中用了75ul的Buffer RLT,则只用75 ul 70%乙醇。
5.将样本(包括可能形成的沉淀)加入到柱子中(柱子放在一个2ml的收集管中),轻轻盖上管盖, 8000×g ( or 10000rpm)离心15s,弃掉过滤到收集管中的液体。收集管继续用
6.加入350 ul的Buffer RW1 到柱子中,轻轻盖上管盖,8000×g(or 10000rpm)离心15s洗柱子,弃掉收集管中的液体,接第8步。
7.在70 ul Buffer RDD中加入 10 ul DNase 1溶液,轻轻翻转 试管 混匀。(勿振荡)
8.吸起上述 80ul 混合液加入柱子中的硅胶薄膜上,室温放置15min。(勿加到管壁上)
9 吸350ul Buffer RW1 到柱子中, 8000×g(or 10000rpm)离心15s,弃掉收集管及收集管中的液体。
10.将柱子转到1个新的2ml 收集管中,加500 ul Buffer RPE 到柱子中,轻轻盖上 试管 8000×g(or 10000rpm)离心15s洗柱子,弃掉收集管中的液体,收集管再用。
11.加500 ul 80%乙醇 到柱子中,轻轻盖上管盖,8000×g(or 10000rpm)离心2 min 以使硅胶薄膜干燥,弃掉收集管及收集管中的液体。(柱子不要碰到收集管中的液体)
12.将柱子转入1个新的2ml 管中,打开盖子,以最大速度离心5min,弃掉收集管和管中的液体。
13.将柱子转入1个新的1.5ml 的EP管中,加14 ul 去RNA酶的水到硅胶薄膜上,轻轻盖上盖子,以最大速度离心1min,将所得RNA溶液做逆转录或保存。