蛋白质组学表面增强激光解吸电离方法
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表面增强激光解吸电离(surface-enhanced laser desorption/ionization,SELDl)技术基于MALDI技术,利用了其测量部分。SELDI涉及一个在特殊化学表面的亲和俘获过程,随后利用激光解吸电离探测进行质量分析(Merchant和Weinberger,2000)。
SELDI过程可以描述为4个部分。
①通过对芯片的洗染,以达到在一个蛋白质芯片阵列上亲和俘获或几个蛋白质的目的。
②洗掉不能与这个芯片表面结合的材料。
③利用SELDI-TOF-MS仪器读人保留的一个或几个目标蛋白,直接提供目标蛋白的分子量。
④通过将图谱视为分布图(profiles)来处理。如有上调或下调信号,此分析与比较2D―PAGE图像类似。
生物 分子通过疏水作用、静电或共价键作用、Lewis酸―碱作用结合到表面。可以利用将目标分子通过共价键作用连接到表面(抗体、受体、酶、DNA、配基、凝集素等)制备具有生物化学表面的微阵列。
SELDI方法可以测量完全蛋白质分子的分子量,范围达到几十千道尔顿。这项技术特别适合于蛋白质剖析处理、相关的软件进行聚类分析。从原理上讲,残留蛋白质的鉴定可以利用胰蛋白酶处理、肽质量指纹或利用串联质谱分析芯片上的肽来完成。现在仍然有一些敏感和复杂的项目在利用这种处理方法。