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外泌体是一种细胞分泌的小囊泡,内含有多种生物大分子,如蛋白质、核酸、脂质等。外泌体可以通过蛋白质组学等方法进行研究,从而发现新的生物标志物、治疗靶点等。常见的外泌体蛋白质组学研究项目包括:
外泌体蛋白质鉴定:通过质谱等技术,鉴定外泌体中的蛋白质,包括高丰度蛋白质和低丰度蛋白质。
蛋白质富集和分离:通过各种蛋白质富集和分离技术,如凝胶电泳、液相色谱等,对外泌体蛋白质进行分离和富集,以便于后续的分析和鉴定。
生物信息学分析:对鉴定出的蛋白质进行生物信息学分析,如功能注释、通路分析等,以发现与疾病相关的蛋白质和通路。
蛋白质定量:通过比较对照组和实验组的外泌体蛋白质组,发现差异表达的蛋白质,从而发现新的生物标志物。
蛋白质交互作用:通过蛋白质交互作用的研究,发现蛋白质间的相互作用关系,从而揭示其在生物过程中的功能和调控机制。
总之,外泌体可以进行多种蛋白质组学研究,发现新的生物标志物和治疗靶点,为临床医学研究和治疗提供了新的思路和方法。
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可以做分泌蛋白微量蛋白相关的蛋白质组学
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可以做NPC细胞系C666-1和非肿瘤性NP细胞系(NP69和NP460)。
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外泌体样本可以做 4D label free、DIA(DIA 2.0 和大样本 4D-DIA)和 4D 磷酸化蛋白质组学。由于外泌体抽提得到的蛋白量相对较少,除非客户特别要求且蛋白量充足,否则小样本量的时候,都建议优先推荐4D label free,而不推荐 TMT。
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