顺式作用元件启动子
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顺式作用元件启动子
启动子是一段特定的直接与RNA 聚合酶及转录因子相结合、决定基因转录起始与否的DNA序列。真核启动子不像原核启动子那样有明显共同一致的序列，一般包括转录起始点及其上游100～200bp序列，包含有若干具有独立功能的DNA序列元件，每个元件长7～30bp。不同的启动子对RNA聚合酶的亲和力不同，所结合的反式作用因子(transactingfactors)也不同，因此，基因转录活性也不相同。
典型的启动子由TATA框及上游的CAAT框和(或)GC框组成，这类启动子通常具有一个转录起始点及较高的转录活性。主要包括以下两个序列：①在5’端转录起始点上游约20―30个孩苷酸的地方，有TATA框(TATA box)，也称为核心启动子元件(corepromoterelement)。TATA框是一个短的核苷酸序列，其碱基序列为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个序列，它是RNA聚合酶的重要的接触点，它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。控制转录起始的准确性及频率。当TATA框中的碱基序列有所改变时，mRNA的转录就会从不正常的位置开始。②在5’端转录起始点上游约70～80个核苷酸的地方，有CAAT框(CAATbox)。CAAT框是启动子中另一个短的核苷酸序列，其碱基序列为GGCTCAATCT。CAAT框是RNA聚合酶的另一个结合点，它的作用还不很肯定，但一般认为它控制着转录的起始频率，而不影响转录的起始点。当这段序列被改变后，mRNA的形成量会明显减少。这些共有序列就是顺式作用元件的核心序列，它们是真核RNA聚合酶或特异转录因子的结合位点。
还有很多启动子并不含TATA框，这类启动子分为两类：一类为富含GC的启动子，最初发现于一类管家基因，这类启动子包括一个或数个分离的转录起始点；另一类启动子既不含TATA框，也没有GC富含区。这类启动子可有一个或多个转录起始点，但多数转录活性很低或根本没有转录活性，而是在胚胎发育、组织分化或再生过程中受调节。
哺乳类RNA聚合酶Ⅱ启动子中常见的元件
