蛋白质组学的研究内容
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蛋白质组学的研究内容
蛋白组学的研究范畴包括蛋白质表达水平、氨基酸序列、翻译后加工和蛋白质相互作用，从而在蛋白质水平上了解细胞的各项功能、各种生理和生化过程以及疾病的病理过程等。但要对“全部蛋白质”进行研究是非常困难的，实际研究中获得的蛋白质组分通常只是总蛋白质组的一部分。新的研究理念――“功能蛋白组学”(functional proteomics)的提出解决了这一难题，其研究对象是功能蛋白质组，即细胞在某一阶段或某一生理或病理现象相关的所有蛋白质，它是介于个别蛋白质的传统蛋白质化学研究和以全部蛋白质为研究对象的蛋白质组学研究之间的层次，对特定时间、特定空间或特定条件下的基因组所表达的蛋白质群体进行研究，从局部人手研究蛋白质的各个功能亚群体，以便将来把多个群体组合起来，逐步描绘出接近于生命细胞的“全部蛋白质”的蛋白质图谱。
1．蛋白质组学的研究内容
(1)表达蛋白质组学(expressionproteomics)：是对蛋白质组表达模式的研究，即检测细胞、组织中的蛋白质，建立蛋白质定量表达图谱，或扫描表达序列(EST)图谱。在整个蛋白质组水平上提供了研究细胞通路、疾病、药物相互作用和一些生物刺激引起的功能紊乱的可能性，对寻找疾病诊断标志、筛选药物靶点、毒理学研究等具有重要作用。
(2)细胞图谱蛋白质组学(cellmapproteomocis)：是对蛋白质组功能模式的研究，即确定蛋白质在亚细胞结构中的位置和鉴定蛋白质复合物组成等，便于研究蛋白质在细胞内的行为、运输及蛋白质相互作用网络关系，它对确定蛋白质功能和疾病诊疗的靶位极有价值。
目前研究主要集中在蛋白质组表达模式方面，但是蛋白质功能模式的研究是蛋白质组研究的最终目标。
2．蛋白质组学的前沿研究方向
(1)针对基因组或转录数据库的生物体／组织／细胞，建立蛋白质组或亚蛋白质组(或蛋白质表达谱)及其蛋白质连锁群，即构成蛋白质组学(compositionalproteomics)研究。选择1―2种具有重要生物学意义或性状且我国已经完成cDNA大规模测序的组织或细胞，制备其高分辨率的蛋白质组图，建立蛋白质数据库，进而联合应用cDNA大规模测序的数据，规模化地研究其蛋白质组成。
(2)以重要生命过程或人类重大疾病为对象，进行重要病理／生理体系或过程的比较蛋白质组学研究。选择l一2类重大生命活动或重大疾病中几个相继的重要阶段，分别进行蛋白质作图，进行系统的定性和定量比较，进而对差别蛋白质进行鉴定，然后从核酸、蛋白质两个水平进行研究，从而确定重大生命活动的蛋白质基础。
(3)蛋白质组学支撑技术平台和生物信息学的研究。支撑技术平台包括：新型蛋白质结构、功能预测的方法及程序；高通量系统及蛋白质组分析自动操作系统；蛋白质分析鉴定中新型质谱技术的发展及应用；大规模蛋白质相互作用分析技术。生物信息学包括：蛋白质组成员的序列、结果、功能及定位分类；基于生化途径、遗传网络等，构建蛋白质组功能系统即蛋白连锁图；建立人或其他动物的蛋白质组数据库；高等生物基因组中蛋白质编码基因的识别及算法研究；基因翻译产物的结构、功能预测；基于蛋白质数据库与知识库的知识与规律发现。
