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24cm IPG胶条二维电泳

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实验步骤

 

1. 清洗器具用品:清洗所有的干胶条套件,包括胶条槽、盖片、托盘等。用Ettan IPGphor胶条槽清洗剂(Amersham Biosciences.),并用大量去离子水冲洗,自然干燥备用。

2. 第一向等电聚焦电泳

   1) 加样和IPG干胶条再水化:采用样品加在再水化液中方法进行加样。24cm IPG胶条(PH3 -10Non-line )。银染蛋白质上样量为40ug-50ug。根据上样量计算出样品上样的体积,加入样品水化液,使总体积为450ul,充分混匀。将液体平铺在胶槽内。取24cmIPG干胶条,从酸性端(尖端)一侧剥去胶条保护膜,胶面向下,先将阳性端(尖端)放入胶条内,慢慢下压胶条,避免产生气泡,最后放下胶条平端(阴极端),使水化液浸湿整个胶条,并确保胶条两段和胶槽两端电极接触。在胶条上覆盖植物油,盖上盖子。

采用再水化同时上样的方法。低电压再水化的步骤编为利用Ettan IPGphor进行电泳的第一步,再水化时间为12小时。

   2) 设置等电聚焦电泳条件:在Ettan IPGphor等电聚焦设备上采用再水化同时上样方法进行IPG等电聚焦。再水化和等电聚焦温度均为20℃,电流最强上限为每胶条50uA,再水化时间12h。

第一步再水化:    30V    6h

                                60V    6h

第二步:              500V   1h

第三步:          1000V   1h

第四步:          8000V   20h

结束:8000V,    64,000Vh。

3. IPG胶条平衡:两步平衡

第一步平衡:IPG胶条分别放入试管内,支持膜贴着管壁。加入10 ml含有DTT的平衡液。每10 ml平衡缓冲液中加入100 mg DTT,用盖子盖住试管或用封口膜封住试管,将其平放在摇床上,平衡15分钟。

第二步平衡:用含碘乙酞胺的平衡溶液(不含DDT)进行第二步平衡,在每10mlSDS平衡缓冲液中加入250 mg碘乙酰胺。

4. SDS-PAGE

   1) 配胶:12.5%均一SDS聚丙烯酰胺凝胶,单块胶总量100 ml。

   2) 灌胶:将配制好的胶液灌入模具中,至顶部3 cm左右。胶面上加入水饱和正丁醇20ul/块。2小时后,可以使用。观察凝胶,确保聚合反应均匀完全,凝胶内部没有气泡,并且凝胶的顶部表面平展。倒掉覆盖在凝胶上的溶液,用凝胶储存液冲洗凝胶表面。

   3) 放置IPG胶条和加入分子量标准蛋白:将平衡后的胶条,放置于凝胶的顶部。加入分子量标准蛋白:将上样滤纸片剪成约1 X 2 mm2 ,放在玻璃板上,分子量标准蛋白与等体积的1%琼脂糖混匀,溶液加到上样滤纸片上。用镊子将上样滤纸片放置在IPG胶条末端一侧(右侧)的凝胶表面。

   4) 琼脂糖封胶液固定IPG胶条: 0.5%琼脂糖水浴加温,在100℃条件下,使每管琼脂糖封胶液融化大概需要10分钟。当封胶液达到60℃时(用手能拿住),缓慢地吸取足够量的密封液(每块凝胶需要1-1.5 ml)将IPG胶条完全覆盖。不要产生气泡。

   5) 电泳条件:起始设置2 W/gel,1 h;5 W/gel,1 h;然后以恒定功率15 W/gel,4-5 h,当澳酚蓝指示条带达胶面底端时结束电泳。

5. 银染及结果分析:试剂配制如下:

 

取出凝胶板,剥胶,置于存有染液的托盘内在摇床上轻轻摇动。采用银染方法。

   1) 固定:凝胶置于固定液中(乙醇200 ml、乙酸50 ml、加去离子水至500 ml ) 1小时;

   2) 敏化:换敏化液(硫代硫酸钠1 g,醋酸钠34 g、去离子水至350ml、乙纯150ml)敏化30 min;

   3) 水洗:倒出敏化液,用去离子水洗3次,每次5分钟;

   4) 银染:置于银染液(硝酸银溶液1.25 g,加去离子水至500mI)中染色20分钟;

   5) 漂洗:用去离子水500 ml漂洗一次,2分钟;

   6) 显色:加显色液(无水碳酸钠12.5 g加去离子水至500 ml,临用前加甲醛200ul),至蛋白点完全清晰显现,背景干净时为止。约5-10分钟;

   7) 终止二倒出显色液,立即换终止液(乙二胺四乙酸二钠7.3 g,加去离子水至500 ml ) 10 min,终止显色;

   8) 换水:去离子水500 ml飘洗2次,每次10分钟;

   9) 保存:在去离子水中保存留待扫描及图像分析。

6. 凝胶扫描及结果分析:用UMAX扫描仪对凝胶进行扫描,并用Image Master 2D 5.0分析软件对图像进行分析。

注意事项

 

1. 戴手套清洗,不用手接触胶条槽。胶条槽在使用前必须完全干燥。

2. 将所有凝胶模具(电泳槽、玻璃板、厚玻璃板、塑料薄片)、试管、染色用托盘和量筒用去污剂软刷刷洗(用力擦,把胶渍擦干净),避免其他蛋白质污染和以往实验残留物。去离子水反复冲洗两遍,自然干燥。

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