【精华】建立丁香园引物库(2005-3-28更新)
丁香园论坛
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PCR技术在分子生物学领域的重要性自不必多说,各种新的PCR技术也不断涌现。引物的设计是进行各种PCR的重要前提条件。虽然现在有很多软件可以设计并评价引物,但在实际的PCR扩增过程中,必须对反应体系和反应条件进行优化,尤其是引物浓度,Mg2+浓度,退火温度等。有时候无论我们如何优化,也拿不到目的产物,只能重新设计。鉴于在引物的设计和合成过程中所花费的时间、精力和财力(尤其对于新手而言),本着资源共享的原则,建立丁香园引物库(含探针)。
目的:为你为我为大家,打造丁香园自己的引物库,资源共享。
基础:我们在阅读文献的过程中,会看到各种已经优化好的引物;在进行课题试验的过程中,会引用并验证/设计并优化引物。你只需花一点点时间,我们共同把这些引物资源积累起来。
要求:提交的战友要本着认真负责的态度,确保数据的准确性,尤其是引物的序列和发表/参考文献。
鼓励:1.对提交的战友加分鼓励,每成功提交一个基因的引物加1分,欢迎新丁香园友积极参与。
2.对表现突出的战友,我们将根据提交引物的情况,进行季度/月度奖励,给予1~5分的加分鼓励。
3. 对建库做出突出贡献的战友,我们还将争取申请金叶天翔奖励。
使用:提交引物,请在本贴跟帖提交! 使用丁香园引物库,请点击 这里进入(最后更新2004-10-13)。
如使用中有问题,请及时反馈我们,以便修订和完善。
注:不得用于任何商业目的
引物(含探针)提交格式:
1. 物种:
2. 基因名称:
3. 模板:
4. PCR类型及目的:
5. forward primer(5’-3’):
reverse primer(5’-3’):
probe(5’-3’):
6. 产物长度(bp):
7. 引物浓度:
8. 退火温度:
9. Mg2+浓度:
10. 所用仪器:
11. 发表文献(题录格式)或blast结果
12. 提交者ID:
13. 提交者联系方式(可选项):
14. 文献原文(附件):
绿色部分为必填项,其他项目可选填
引物(含探针)提交条件:
1.引物由自己设计,已经实验验证,附发表的文章(含待发表)或blast结果;
2.引物引自文献,附引用文献(已验证的请注明);
3.发表/引用文献需提供原文,或原文的相关部分,以便我们验证。可以附件的形式上传,验证结束后即予以删除,只保留题录格式。如原文过大,上传不便,可只上传相关的部分,或者将原文发至斑竹的E-mail:lhailzhj@yahoo.com.cn
建议:
最好加上你设计引物所用的序列登录号即accession number ,这样验证起来也方便。如果知道unigene或locuslink号最好补上,因为一个基因可能有不同的accession number,而在unigene或locuslink都能找到,以便确定就是所需的引物。
请大家积极参与,提交请在本帖后跟帖,我们验证后,及时整理入库。
--------------------------------------------------------------------------
如果引物是在这个NCI数据库里找的,请注明,加分从减。详见以下连接:
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=2987020&sty=1&tpg=1&age=0
目的:为你为我为大家,打造丁香园自己的引物库,资源共享。
基础:我们在阅读文献的过程中,会看到各种已经优化好的引物;在进行课题试验的过程中,会引用并验证/设计并优化引物。你只需花一点点时间,我们共同把这些引物资源积累起来。
要求:提交的战友要本着认真负责的态度,确保数据的准确性,尤其是引物的序列和发表/参考文献。
鼓励:1.对提交的战友加分鼓励,每成功提交一个基因的引物加1分,欢迎新丁香园友积极参与。
2.对表现突出的战友,我们将根据提交引物的情况,进行季度/月度奖励,给予1~5分的加分鼓励。
3. 对建库做出突出贡献的战友,我们还将争取申请金叶天翔奖励。
使用:提交引物,请在本贴跟帖提交! 使用丁香园引物库,请点击 这里进入(最后更新2004-10-13)。
如使用中有问题,请及时反馈我们,以便修订和完善。
注:不得用于任何商业目的
引物(含探针)提交格式:
1. 物种:
2. 基因名称:
3. 模板:
4. PCR类型及目的:
5. forward primer(5’-3’):
reverse primer(5’-3’):
probe(5’-3’):
6. 产物长度(bp):
7. 引物浓度:
8. 退火温度:
9. Mg2+浓度:
10. 所用仪器:
11. 发表文献(题录格式)或blast结果
12. 提交者ID:
13. 提交者联系方式(可选项):
14. 文献原文(附件):
绿色部分为必填项,其他项目可选填
引物(含探针)提交条件:
1.引物由自己设计,已经实验验证,附发表的文章(含待发表)或blast结果;
2.引物引自文献,附引用文献(已验证的请注明);
3.发表/引用文献需提供原文,或原文的相关部分,以便我们验证。可以附件的形式上传,验证结束后即予以删除,只保留题录格式。如原文过大,上传不便,可只上传相关的部分,或者将原文发至斑竹的E-mail:lhailzhj@yahoo.com.cn
建议:
最好加上你设计引物所用的序列登录号即accession number ,这样验证起来也方便。如果知道unigene或locuslink号最好补上,因为一个基因可能有不同的accession number,而在unigene或locuslink都能找到,以便确定就是所需的引物。
请大家积极参与,提交请在本帖后跟帖,我们验证后,及时整理入库。
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如果引物是在这个NCI数据库里找的,请注明,加分从减。详见以下连接:
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=2987020&sty=1&tpg=1&age=0