【分享】RT-PCR的反应体系
丁香园论坛
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一:25UL 体系的量如下:
无RNA酶水 ?
undefinedbuffer 5.0UL
DNTP Mix 1.0UL
Enzyme Mix 1.0UL
primer A ?(0.6M)
Primer B ?(0.6M)
RNA模板 ?(不大于1UL)
Q (RNA酶抑制剂) 可加可不加
二:虽说有几个试剂未知其量,但都是需要算的,给据要求,引物及RNA模板都可计算,具体如下:
1. 引物量的计算:
跟据引物说明书稀释引物,例如:
primer A 1OD 48UL 意思实说:1OD (一般公司给合成的为每管1OD,量为100M)引物加48UL 0.1%DEPC处理12小时以上并高压过的水,混匀,即为母液;然后取10UL于另一EP管中,加30UL0.1%DEPC处理12小时以上并高压过的水,用移液器吹打混匀,即为工作液。注明稀释日期及性质,-20度冰箱备用。
所需引物量为=(0.6undefined40Uundefined48UL)/(100undefined10UL)
同理 Primer B的计算相同 。
2.RNA模板的计算:
一般25UL反应体系中,需500ng或1ug的量,如按照1ug计算:
(1)总RNA浓度一定要知道:可通过测吸光度来计算,1OD=40ug,公式如下:
总RNA浓度=OD值40uundefined稀释倍数/1000 (ug/uL)
(2)所需RNA模板量为=1/总RNA浓度 (uL)
这样水的量就自然定了。
三:具体步骤
(1)先将所用的试剂放于冰盒上
(2)把除引物外的其它试剂都加好,用移液器混匀
(3)再加模板RNA并混匀
(4)将EP管放于已预热的PCR仪中,按照已经设定好的条件开始循环。
四:条件
50° 30min,95° 15min .(94° 45s,Tm-5°,72° 1min~undefined35cycle ,72° 10min ,----4°
待PCR仪中的温度降到4°时,取出RT-PCR产物,电泳,并置于-20°冰箱保存
无RNA酶水 ?
undefinedbuffer 5.0UL
DNTP Mix 1.0UL
Enzyme Mix 1.0UL
primer A ?(0.6M)
Primer B ?(0.6M)
RNA模板 ?(不大于1UL)
Q (RNA酶抑制剂) 可加可不加
二:虽说有几个试剂未知其量,但都是需要算的,给据要求,引物及RNA模板都可计算,具体如下:
1. 引物量的计算:
跟据引物说明书稀释引物,例如:
primer A 1OD 48UL 意思实说:1OD (一般公司给合成的为每管1OD,量为100M)引物加48UL 0.1%DEPC处理12小时以上并高压过的水,混匀,即为母液;然后取10UL于另一EP管中,加30UL0.1%DEPC处理12小时以上并高压过的水,用移液器吹打混匀,即为工作液。注明稀释日期及性质,-20度冰箱备用。
所需引物量为=(0.6undefined40Uundefined48UL)/(100undefined10UL)
同理 Primer B的计算相同 。
2.RNA模板的计算:
一般25UL反应体系中,需500ng或1ug的量,如按照1ug计算:
(1)总RNA浓度一定要知道:可通过测吸光度来计算,1OD=40ug,公式如下:
总RNA浓度=OD值40uundefined稀释倍数/1000 (ug/uL)
(2)所需RNA模板量为=1/总RNA浓度 (uL)
这样水的量就自然定了。
三:具体步骤
(1)先将所用的试剂放于冰盒上
(2)把除引物外的其它试剂都加好,用移液器混匀
(3)再加模板RNA并混匀
(4)将EP管放于已预热的PCR仪中,按照已经设定好的条件开始循环。
四:条件
50° 30min,95° 15min .(94° 45s,Tm-5°,72° 1min~undefined35cycle ,72° 10min ,----4°
待PCR仪中的温度降到4°时,取出RT-PCR产物,电泳,并置于-20°冰箱保存